基因隔离是由种群自然生境内或两生境之间的地理距离和生态特征决定的。在所有谷类作物中,大麦最适合生长在青藏高原(QTP)。本研究的目的是探寻大麦的基因结构与生态地理因子的变异相关性。利用多样性序列芯片技术(DArT),对生活在青藏高原(QTP)不同生态条件下的230个六棱裸大麦叶片进行了基因分型,并以此确认了与地理分布相关的两个种群及4个亚种群。研究表明,种群结构可能与该种群所处的海拔高度相关,而温度和降雨量对亚种群结构的的影响更为显著。在22个离群位点中,9个被鉴定为阳性,这可能与种群对局部环境的适应有关。研究中,我们还观测到某些生态地理因子与特定DArT位点等位基因频率之间的相关性。与适应性相关的DArT标记物的鉴别有利于开发新的种质,并为大麦改良提供相应的变异来源。