中科院文献情报系统由院所两级的文献情报机构组成，协同面向研究所科研一线提供文献情报与知识服务。为贯彻中国科学院文献情报系统中长期发展规划纲要，推进中国科学院文献情报系统“十三五”期间新任务落实，进一步加强和完善全院文献情报工作协同机制，中国科学院文献情报中心牵头组织成立了10个全院文献情报系统的业务协调工作组，通过建立常规沟通和协调机制开展全院文献情报服务，共同决策落实项目任务、重要活动及保障措施，以更好地服务支撑全院科研创新活动。
中国科学院文献情报中心立足中国科学院、面向全国，主要为自然科学、边缘交叉科学和高技术领域的科技自主创新提供文献信息保障、战略情报研究服务、公共信息服务平台支撑和科学交流与传播服务，同时通过国家科技文献平台和开展共建共享为国家创新体系其他领域的科研机构提供信息服务。
中心现有职工400余人，馆藏图书1,145余万册（件）。近年来，围绕国家科技发展需求及中科院“率先行动”计划，积极建设大数据科技知识资源体系，开展普惠的文献信息服务和覆盖研究所创新价值链的情报服务。在分布式大数据知识资源体系建设以及覆盖创新价值链的科技情报研究与服务体系方面获得了重大突破，成为了支持我国科技发展的权威的国家科技知识服务中心。
中心是图书馆学和情报学两个学科的硕士学位和博士学位授予单位，现有在读研究生近178人；常年接收高级访问学者和组织专业继续教育。2012年获批图书馆学、情报学博士后科研流动站。
中国科学院文献情报中心是国际图书馆协会与机构联合会（IFLA）的重要成员。近年来，中心积极组织、参与高层次专门化国际学术交流活动，目前已经与美国、德国、韩国、俄罗斯等多个国家的文献情报机构建立了稳定的合作关系。
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2012年12月8日，中国科学院与安徽省科学技术研究院、北京市科学技术研究院、重庆市科学技术研究院、甘肃省科学院、广东省科学院、广西科学院、贵州科学院、河北省科学院、河南省科学院、黑龙江省科学院、湖南省科学技术研究开发院、江西省科学院、山东省科学院、陕西省科学院、上海科学院、沈阳科学技术总院、武汉市工程科学技术研究院等17家地方科学院成立全国科学院联盟，发布《全国科学院联盟北京宣言》，加强全面战略合作，集聚优质创新资源，共建协同创新体系，实现创新驱动发展。2013年，新疆建设兵团农垦科学院加入，目前联盟成员达到20家。
中国科学院在“民主办院、开放兴院、人才强院”战略的指导下，长期以来为国家经济建设、社会发展和国防安全做出了重要贡献。各地方科学院是区域经济社会发展的重要科技支撑，是国家科技创新体系不可或缺的重要组成部分。成立全国科学院联盟，是全面贯彻落实党的十八大和全国科技创新大会精神的重要举措，是开展联合合作、实现共赢发展的重大创新，是科技服务区域经济社会发展，“调结构、促转型、稳增长”要求的重要行动。
全国科学院联盟文献情报分会是目前已经成立的七个分会之一，主要致力于实现中国科学院与各省级科学院的文献情报服务共享，推动联盟成员机构实现文献情报共享，推进联盟成员机构的业务交流与合作。文献情报分会将本着“资源共享、优势互补、交流合作、共同发展”的原则，依托中国科学院文献情报中心，联合省科学院共享文献信息、情报研究成果，协同提高文献情报服务能力。
中国图书馆学会专业图书馆分会（原名：中央国家机关与科研系统图书馆员学会）正式成立于1979年6月19日，是中国图书馆学会三大主要系统（公共、高校、专业）分支机构之一，属全国性、公益性的二级学术社团。
专业分会的工作宗旨是以“图书情报机构开展知识服务”为工作主线，通过学术交流、专业培训、交流合作和组织发展等活动，积极推进专业领域图书情报机构知识服务能力建设，促进专业图书情报事业的繁荣发展。
专业分会秘书处挂靠单位是中国科学院文献情报中心，所辖会员单位主要来自于国家部、委（局、办）、中央直属单位所属科研系统的图书情报机构。会员单位聚集了国内重要的专业性图情服务机构， 这些机构都是行业系统内图书文献协作网络的龙头单位，发挥着各自系统图书情报工作发展的牵头协调作用。拥有一大批具有各种专业背景的图书情报学专家、学者，是一支有相当学术水平和业务能力的学术社团。 中国科学院文献情报中心主任刘会洲任主任委员，中国化工信息中心主任揭玉斌、中国农业科学院副院长孙坦 、中国科技信息研究所总工程师袁伟、国家科技图书文献中心副主任沈仲祺、中国医学科学院医学信息研究所副所长唐小利、 中国航空工业发展研究中心专务张魁清、中国图书进出口（集团）总公司总经理张纪臣、中国社会科学院图书馆副馆长张大伟任副主任委员，中国科学院文献情报中心副主任 刘细文任秘书长，中科院文献情报中心赵树宜任常务副秘书长。
中国科学院自然科学期刊编辑研究会（Society of Scientific and Technological Periodicals, Chinese Academy of Sciences，SSTP，CAS），主要由中国科学院所属科技期刊工作者组成， 是中国科学院所属的非营利性群众学术团体。
中国科学院自然科学期刊编辑研究会的宗旨是团结广大科技期刊工作者，研究科技期刊的理论、技术和方法，交流编辑工作经验；发挥中国科学院出版管理部门和院属期刊之间的桥梁和纽带作用，加强院属期刊与社会各界、 国内外广大同行的联系；促进会员的职业道德建设，维护会员的合法权益，反映科技期刊工作者的意见和呼声；为广大科技期刊工作者服务，推动中国科学院科技期刊的发展，为中国科学院科技创新服务，为建设创新型国家服务。
中国科学院自然科学期刊编辑研究会成立于1986年，《中国科技期刊研究》月刊为其会刊。首任理事长是时任中国科学院院长的周光召院士。第五届理事会由中国科学院副院长李静海院士任理事长；郭雷院士、刘振兴院士、卢柯院士、 杨国桢院士，朱日祥院士、陈和生院士等14人担任副理事长；中国科学院文献情报中心主任张晓林教授任副理事长兼秘书长；理事115人，其中常务理事56人。 现设立学术工作、编辑出版、组织工作、数字出版、继续教育和国际交流6个工作委员会。
