欢迎来到2020年5月22日的研究综述,这是布罗德研究所(Broad Institute)的科学家和他们的合作者发表的最新研究的一个循环快照。
Cas9不需要指导来切割DNA
Oana Enache、Veronica Rendo (DFCI)、癌症项目副成员Rameen Beroukhim、核心成员和癌症项目主任Todd Golub、Uri Ben-David(现在在特拉维夫大学)和他们的同事在《自然遗传学》杂志上表明,Cas9可以在没有任何引导RNA的情况下切割DNA。此外,当Cas9被引入细胞系时,最终促进了p53基因突变细胞的生长——在许多癌症中也发现了同样的突变。研究小组发现,当他们将Cas9引入165个细胞系时,有很高比例的p53通路被激活。在这些细胞系的一小部分中,研究人员发现了使p53失去活性的突变。作者建议,研究人员可以修改他们的基因组编辑管道,以避免或减轻这些脱靶效应。阅读更多问答与Uri在广泛的网站。
心电图指向心律失常的遗传标记
心血管疾病倡议组织(CVDi)的副成员Steven Lubitz和他的同事进行了一项GWAS研究,以寻找心律失常的遗传标记。他们观察了PR间隔的异常情况,PR间隔是心电图的一种测量,反映房室传导,与许多常见的电生理疾病有关,如房颤和缓性心律失常。通过对293051人的队列研究,研究人员发现了202个基因组位置,其中141个位置此前未被发现。这些位点共同解释了这一性状大约62%的遗传可能性。请阅读自然通讯和广泛的故事。
没有想象的空间
将组织与水凝胶融合,创造出一种能够实现完整生物系统的精细结构和分子表型的杂交体,但这种杂交体面临着渗透性和稳定性的问题。由麻省理工学院(MIT)的顾大云(Taeyun Ku)和来自Regev实验室和麻省理工学院的副成员钟宽杭(Kwanghun Chung)领导的一个团队已经发明了一种名为“缠绕增强可拉伸组织水凝胶”(ELAST)的技术,这种技术可以使组织具有弹性,形成结构稳定的水凝胶,同时能够快速运输分子探针。在《自然方法》中描述,该方法允许组织在没有机械损伤的情况下被拉伸或压缩,并可能加强对动物模型和临床人体样本组织的研究。
对脆性X综合征的治疗见解
脆性X综合征(FXS)是自闭症和智力残疾的遗传原因。GSK3酶,有两个亚型GSK3αGSK3β,是与许多疾病包括神经系统疾病。先前的研究表明,GSK3选择性抑制剂可能有潜力治疗小鼠模型中的FXS,但也会导致毒性。导演斯坦利精神病学研究中心的药物化学和疗法的发展中心(CDoT)佛罗伦萨瓦格纳和合作者在《科学-转化医学,主要毒性可以避免GSK3α的选择性药物抑制。作者还报告说,抑制GSK3α足以正确的一系列疾病表型FXS的小鼠模型,而抑制GSK3β是无效的。
EBV如何躲避免疫系统
一旦人感染了eb病毒(EBV),它就会在人的余生中留在体内,并且每年与20万人类癌症有关。这种病毒要想在终身感染中避开免疫系统,它的许多基因必须被抑制。由瑞·郭(Rui Guo)和布莱根大学(Brigham)的副成员本·吉乌兹(Ben Gewurz)以及来自遗传微扰平台(Genetic ation Platform)的同事领导的一个团队,在伯基特淋巴瘤细胞中进行了EBV的CRISPR-Cas9敲除筛选,以确定参与该基因沉默的细胞因子。他们的研究结果指向了操纵病毒的潜在治疗靶点。请阅读《自然微生物学》的全文。
一无所有
在癌细胞中,许多基因通过一种称为杂合性缺失(LOH)的现象失去了它们的两个亲代等位基因中的一个。Caitlin Nichols, Brenton Paolella, Beroukhim和他的同事在《自然通讯》杂志上报道,那些通常不被认为是癌症易损性的关键基因(例如,产生能量或消除废物的基因),可以通过利用LOH转化为强大的治疗靶点。他们写道,干扰LOH后残留的基本基因等位基因的方法,可以在不影响正常细胞的情况下,对癌细胞造成严重破坏。从Dana-Farber的故事中了解更多。
研究人员对单个细胞进行研究,以了解为什么儿童通常能更好地抵御COVID-19
# WhyIScience问答,卡拉曼细胞亚历克斯Shalek天文台研究所成员和准会员何塞Ordovas-Montanes在波士顿儿童医院谈一个新的研究COVID-19疾病的儿童,这是做在波士顿儿童医院与医生合作,科学家们广泛作为人类细胞图谱计划的一部分。他们还谈到在COVID时代,他们的研究方法和单细胞基因组学领域发生了怎样的变化。