CD8+ T细胞是对抗丙型肝炎病毒（HCV）适应性免疫反应成功的主要成分。对HCV疫苗设计的一个主要障碍是它的固有序列的多样性。我们检测了如下假说：免疫显性CD8+ T细胞表位的差异序列，均与I型HLA紧密结合，靶向全部不同T细胞受体，并影响CD8+ T细胞应答的质量。对HLA-A*02-限制性丙型肝炎病毒表位NS31406–1415序列差异对来自血清反应阴性捐献者的体外原始CD8+ T细胞的启动及已启动的T细胞的与其他不同表位的交叉反应的影响进行了描述。虽然这六个被检测的不同表位均HLA-A*02:01紧密结合，在CD8+ T细胞的启动和交叉反应中存在本质差别。与具有广泛交叉反应的T细胞最具可再生启动和诱导相关的改变是基因型1b变异体，它在亚洲分离得到的HCV中更为常见而在欧洲和北美很少见。这种相对少见的表位变异体的高免疫原性和交叉反应通过来自注射毒品的人群的HCV特异性记忆CD8+ T细胞得到验证。总而言之，这些数据表明HCV分离种群表位水平的序列差异可能影响CD8+ T细胞的启动及与其他表位变异体的交叉反应水平。
重要性：该结果对设计针对高变异病原体疫苗具有重要意义，揭示出能改善免疫原性和T细胞交叉反应的疫苗抗原序列基于证据的选择。交叉反应性CD8+ T细胞可能对谢爱病毒变异体的传染病毒的免疫控制有利，并可预防急性感染时的免疫逃脱。罕见表位变异体和与广泛交叉反应性T细胞受体启动相关的可能已经改变的表位序列，可被用于疫苗设计中，但仍需进一步验证。
