《SARS-CoV-2非结构多蛋白1a的HLA-A*02:01限制性候选表位的鉴定,该表位可能是体内CD8+T细胞识别的天然靶点》

  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2021-03-01
  • COVID-19疫苗正在迅速发展,人体试验正在进行中。几乎所有这些疫苗都被设计成诱导针对SARS-CoV-2棘突蛋白的抗体以期望中和活性。然而,非中和抗体有引起抗体依赖性增强的风险。此外,SARS-CoV-2特异性抗体的寿命非常短。因此,除了抗体诱导疫苗外,还应考虑在SARS-CoV-2特异性细胞毒性T淋巴细胞(ctl)基础上开发新的疫苗。在这里,我们试图鉴定来自SARS-CoV-2非结构多蛋白1a的HLA-A*02:01限制性CTL表位。基于生物信息学,82个肽被首次预测为候选表位。82个肽中有54个与HLA-A*02:01有高度或中度结合亲和力。用脂质体包裹的54个肽分别免疫HLA-A*02:01转基因小鼠。细胞内细胞因子染色显示54个肽中有18个具有CTL表位活性,这是由于γ-干扰素(IFN-γ)诱导产生CD8+T细胞。在这18种肽中,选择了10种肽进行以下分析,因为它们具有很高的响应性。用含有10种多肽混合物的脂质体免疫小鼠,以鉴定优势CTL表位。一些肽在统计学上优于其他肽。令人惊讶的是,所有用脂质体10肽混合物免疫的小鼠对10肽没有表现出相同的反应模式。共有三种反应模式,表明肽疫苗接种后存在免疫优势层次,这可能为设计基于CTL的COVID-19疫苗提供更多的表位选择。

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    • 来源专题:病毒性肝炎防治
    • 编译者:李爱花
    • 发布时间:2014-12-18
    • CD8+ T细胞是对抗丙型肝炎病毒(HCV)适应性免疫反应成功的主要成分。对HCV疫苗设计的一个主要障碍是它的固有序列的多样性。我们检测了如下假说:免疫显性CD8+ T细胞表位的差异序列,均与I型HLA紧密结合,靶向全部不同T细胞受体,并影响CD8+ T细胞应答的质量。对HLA-A*02-限制性丙型肝炎病毒表位NS31406–1415序列差异对来自血清反应阴性捐献者的体外原始CD8+ T细胞的启动及已启动的T细胞的与其他不同表位的交叉反应的影响进行了描述。虽然这六个被检测的不同表位均HLA-A*02:01紧密结合,在CD8+ T细胞的启动和交叉反应中存在本质差别。与具有广泛交叉反应的T细胞最具可再生启动和诱导相关的改变是基因型1b变异体,它在亚洲分离得到的HCV中更为常见而在欧洲和北美很少见。这种相对少见的表位变异体的高免疫原性和交叉反应通过来自注射毒品的人群的HCV特异性记忆CD8+ T细胞得到验证。总而言之,这些数据表明HCV分离种群表位水平的序列差异可能影响CD8+ T细胞的启动及与其他表位变异体的交叉反应水平。 重要性:该结果对设计针对高变异病原体疫苗具有重要意义,揭示出能改善免疫原性和T细胞交叉反应的疫苗抗原序列基于证据的选择。交叉反应性CD8+ T细胞可能对谢爱病毒变异体的传染病毒的免疫控制有利,并可预防急性感染时的免疫逃脱。罕见表位变异体和与广泛交叉反应性T细胞受体启动相关的可能已经改变的表位序列,可被用于疫苗设计中,但仍需进一步验证。
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    • 编译者:蒋君
    • 发布时间:2021-03-01
    • SARS-CoV-2(一种冠状病毒)是导致COVID-19大流行的原因。SARS-CoV-2尖峰(S)糖蛋白三聚体介导病毒进入宿主细胞和细胞病变效应(合胞体形成)。我们研究了几种S糖蛋白特征对这些功能的贡献,重点研究了相关冠状病毒之间的差异。SARS-CoV-2 S糖蛋白获得弗林蛋白酶切割位点降低了病毒的稳定性和感染性,但极大地增强了合胞体形成能力。值得注意的是,在全球主要的SARS-CoV-2菌株中发现的D614G变化增加了传染性,对ACE2受体的反应性适度增强,对中和血清的敏感性增强,并且S1亚基与三聚体的结合更紧密。显然,SARS-CoV-2 S糖蛋白的这两个特征,弗林蛋白酶切割位点和D614G,已经发展以平衡病毒的感染性,稳定性,细胞病变性和抗体易感性。尽管病毒进入或合胞体形成并非绝对需要S2亚基的内结构域(胞质尾巴),但胞质尾巴中棕榈酰化半胱氨酸残基的改变降低了这些过程的效率。由于蛋白水解切割有助于SARS-CoV-2 S糖蛋白的激活,因此我们评估了蛋白酶抑制剂抑制S糖蛋白功能的能力。基质金属蛋白酶抑制剂可抑制S介导的细胞间融合,但不能抑制病毒进入。基质金属蛋白酶抑制剂与TMPRSS2之间的协同作用表明,两种宿主蛋白??酶都可以在合胞体形成过程中激活S糖蛋白。 有效和持久的SARS-CoV-2疫苗的开发对于对抗日益增长的COVID-19大流行至关重要。SARS-CoV-2峰值(S)糖蛋白是中和病毒感染或疫苗接种后引发的抗体的主要靶标。了解尖峰糖蛋白的进化,功能以及与宿主因素的相互作用将有助于研究人员开发有效的疫苗免疫原和治疗方法。在这里,我们确定了峰值糖蛋白的关键特征,包括弗林蛋白酶切割位点和D614G自然突变,这些特征可调节病毒的细胞病变效应,感染性和抑制敏感性。我们还确定了宿主金属蛋白酶的两种抑制剂,它们能阻止S介导的细胞-细胞融合,该过程有助于破坏病毒感染的细胞。