2023年9月21日，美国加利福尼亚大学的研究人员在cell上发表题为SARS-CoV-2 variants evolve convergent strategies to remodel the host response的论文。该研究使用无偏系统方法研究了驱动变异体（VOCs）演化的宿主选择性力量，发现VOCs 通过调节病毒 RNA 和蛋白质水平、改变病毒和宿主蛋白质磷酸化以及重构病毒-宿主蛋白质-蛋白质相互作用，进化出重塑宿主的趋同策略。
综合计算分析表明，虽然 Alpha、Beta、Gamma 和 Delta 最终都会抑制干扰素刺激基因（ISG），但 Omicron BA.1 却不会。ISG 抑制与病毒先天免疫拮抗蛋白（包括 Orf6、N 和 Orf9b）的表达相关，研究人员将其映射到特定的突变上。与早期亚变体 BA.1 相比，后期 Omicron 亚变体 BA.4 和 BA.5 对先天性免疫的抑制作用更强，这与Orf6的水平有关，但在BA.4中，Orf6-核孔相互作用被突变所破坏。该研究结果表明，SARS-CoV-2的趋同进化克服了人类适应性免疫和先天性免疫障碍，为应对未来的大流行奠定了基础。
