COVID-19 大流行凸显了基于单克隆抗体的预防和治疗药物的前景1,2,3并揭示了病毒逃逸的速度可以减少有效的选择4,5.当 SARS-CoV-2 Omicron 变体在 2021 年出现时，许多抗体药物产品失去了效力，包括 Evusheld 及其成分 cilgavimab4,5,6.Cilgavimab 与其祖先 COV2-2130 一样，是一种 3 类抗体，与其他抗体组合兼容4并且很难用现有方法取代。快速修改这些高价值抗体以恢复对新出现的变异株的疗效是一种令人信服的缓解策略。我们试图重新设计和更新 COV2-2130 对 Omicron BA.1 和 BA.1.1 毒株的功效，同时保持对主要 Delta 变体的功效。在这里，我们表明，我们经过计算重新设计的抗体 2130-1-0114-112 实现了这一目标，同时提高了对 Delta 和后续关注变体的中和效力，并在体内提供针对测试菌株的保护：WA1/2020、BA.1.1 和 BA.5。对数以万计的假病毒变体进行深度突变扫描后发现，2130-1-0114-112 在不增加逃逸风险的情况下提高了广泛的效力。我们的结果表明，计算方法可以优化抗体以靶向多种逃逸变体，同时丰富效力。我们的计算方法不需要实验迭代或预先存在的绑定数据，因此能够实现快速响应策略来解决逃逸变体或减少逃逸漏洞。
文献信息：Desautels, T.A., Arrildt, K.T., Zemla, A.T. et al. Computationally restoring the potency of a clinical antibody against Omicron. Nature (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07385-1
