2024年5月8日,劳伦斯-利弗莫尔国家实验室的研究人员在Nature上发表了一篇题为Computationally restoring the potency of a clinical antibody against Omicron的文章。
SARS-CoV-2大流行凸显了基于单克隆抗体的预防和治疗药物的前景 ,同时也揭示了病毒逃逸会如何迅速地削减有效的选择。2021 年,当Omicron 变种出现时,许多抗体药物产品失去了效力,包括 Evusheld 及其成分西格维单抗。西格维单抗和它的祖先 COV2-2130 一样,都是Ⅲ类抗体,可与其他抗体联合使用 。用现有方法替代具有挑战性,快速改造这种高价值抗体以恢复对新出现变体的疗效是一种令人信服的缓解策略。研究人员试图重新设计和更新 COV2-2130 对 Omicron BA.1 和 BA.1.1 毒株的疗效,同时保持对优势 Delta 变异株的疗效。
该研究展示了通过计算重新设计的抗体 2130-1-0114-112,它实现了这一目标,同时提高了对 Delta 及其后相关变异株的中和效力,并在体内对测试的毒株提供保护: WA1/2020、BA.1.1 和 BA.5。对数以万计的假病毒变异株进行深度突变扫描后发现,2130-1-0114-112 在提高广泛效力的同时不会增加逃逸责任。
该研究结果表明,计算方法可以优化抗体,使其针对多种逃逸变体,同时提高效价。该计算方法不需要实验迭代或预先存在的结合数据,因此可以采用快速反应策略来解决逃逸变异或减少逃逸漏洞。