信息名称:尼日利亚SARS-CoV-2的系统进化分析
1.时间:2020年6月14日
2.机构或团队:尼日利亚Precious Cornerstone大学、尼日利亚Adeleke大学、尼日利亚Fountain大学
3.事件概要:
尼日利亚Precious Cornerstone大学等机构在New Microbes and New Infections发表论文“Phyloevolutionary analysis of SARS-CoV-2 in Nigeria”。
系统的进化分析为揭示感染的出现和演变,了解SARS-CoV-2在尼日利亚的爆发和传播将有助于提供预防措施,以减少高危人群之间的传播。2020年3月29日,文章从GISAID EpiFluTM数据库中检索了39个SARS-CoV-2的完整基因组,以调查其在尼日利亚的进化情况,根据患者的旅行史和采集日期选择序列。
在一般时间可逆模型的基础上,利用极大似然法推导出进化史,构建系统发育树,确定各菌株的共同祖先。系统发育分析表明,该尼日利亚菌株和武汉宗支属一个单系分支,核苷酸序列也显示了100%的相似性,表明了具有相同的进化起源。
4.附件:
原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S205229752030069X