《尼日利亚SARS-CoV-2的系统进化分析》

• 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
• 编译者： hujm
• 发布时间：2020-06-29
• 原文来源：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S205229752030069X

尼日利亚Precious Cornerstone大学等机构在New Microbes and New Infections发表论文“Phyloevolutionary analysis of SARS-CoV-2 in Nigeria”。
系统的进化分析为揭示感染的出现和演变，了解SARS-CoV-2在尼日利亚的爆发和传播将有助于提供预防措施，以减少高危人群之间的传播。2020年3月29日，文章从GISAID EpiFluTM数据库中检索了39个SARS-CoV-2的完整基因组，以调查其在尼日利亚的进化情况，根据患者的旅行史和采集日期选择序列。
在一般时间可逆模型的基础上，利用极大似然法推导出进化史，构建系统发育树，确定各菌株的共同祖先。系统发育分析表明，该尼日利亚菌株和武汉宗支属一个单系分支，核苷酸序列也显示了100%的相似性，表明了具有相同的进化起源。