登录
 机构网站
  1. 首页
  2. 情报产品
  3. 快讯详情

《3月7日_SARS-CoV-2的RNA直接测序和早期进化》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-03-09

  • 1.时间：2020年3月7日

    2.机构或团队：墨尔本大学；澳大利亚皇家墨尔本医院

    3.事件概要：

    2020年3月7日，bioRxiv预印平台发布了澳大利亚墨尔本大学和皇家墨尔本医院的文章“Direct RNA sequencing and early evolution of SARS-CoV-2”。文章指出，随着SARS-CoV-2的暴发，对SARS-CoV-2的基因分析在设计分子诊断和监测流行病学等方面有重要作用，并能为揭示SARS-CoV-2的生物学特性提供帮助。为了进一步对SARS-CoV-2进行基因水平上的分析，研究人员首次利用RNA直接测序技术得到了SARS-CoV-2亚基因组长度的mRNA结构，并通过系统发育分析方法，预估了在暴发早期阶段SARS-CoV-2的进化速率和进化时间尺度。这些信息对SARS-CoV-2传播进化的预测和建模提供了支持。

    *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。

    4.附件：

    原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.05.976167v1

  • 原文来源：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.05.976167v1
117浏览量
原文链接
相关报告

  • 《SARS-CoV-2的RNA直接测序和早期进化》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-03-15
    • 2020年3月7日，bioRxiv预印平台发布了澳大利亚墨尔本大学和皇家墨尔本医院的文章“Direct RNA sequencing and early evolution of SARS-CoV-2”。文章指出，随着SARS-CoV-2的暴发，对SARS-CoV-2的基因分析在设计分子诊断和监测流行病学等方面有重要作用，并能为揭示SARS-CoV-2的生物学特性提供帮助。为了进一步对SARS-CoV-2进行基因水平上的分析，研究人员首次利用RNA直接测序技术得到了SARS-CoV-2亚基因组长度的mRNA结构，并通过系统发育分析方法，预估了在暴发早期阶段SARS-CoV-2的进化速率和进化时间尺度。这些信息对SARS-CoV-2传播进化的预测和建模提供了支持。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
    165浏览量
    原文链接

  • 《3月3日_关于SARS-CoV-2的起源和进化》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2020-03-05
    • 1.时间：2020年3月3日 2.机构或团队：北京大学、中国科学院上海巴斯德研究所、中国科学院生物安全大科学中心、中国科学院大学、上海大学生命科学学院、中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所 3.事件概要： 北京大学等于2020年3月3日在National Science Review上发表题为“On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2”的文章,研究了SARS-CoV-2与其他相关冠状病毒之间的分子差异程度。 文章指出，尽管他们发现SARS-CoV-2与蝙蝠SARS相关冠状病毒（SARSr-CoV; RaTG13）之间仅4％的基因组核苷酸有差异，但中性位点有17％的差异，表明这两种病毒之间的差异要比以前估计的大得多。作者指出，SARS-CoV-2和穿山甲SARSr-CoVs病毒中刺突蛋白受体结合域（RBD）功能位点的新变异，除了重组外，还可能是由突变和自然选择引起的。研究人员对103个SARS-CoV-2基因组进行的群体遗传学分析表明，这些病毒进化成两种主要类型（命名为L和S），它们显示了迄今为止测序的病毒株之间都相关。虽然L型（?70％）比S型（?30％）更为普遍，但S型是原始版本。虽然L型在武汉暴发的早期阶段更为普遍，但在2020年1月初之后，L型的出现频率有所下降。人类的干预可能对L型施加了更严重的选择压力，L型可能更具侵略性，传播速度更快。另一方面，S型的进化年龄更大，攻击性更弱，可能由于相对较弱的选择压力而增加了相对的出现频率。作者总结，这些发现有力地支持迫切需要对COVID-19患者的临床症状结合基因组数据、流行病学数据和图表记录进行进一步的、即时的、全面的研究。 4.附件： 原文链接： https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463?searchresult=1
    183浏览量
    原文链接