牛津大学、爱丁堡大学和剑桥大学的研究人员1月8日在期刊Science上在线发表了题为“Establishment and lineage dynamics of the SARS-CoV-2 epidemic in the UK”的文章。
文章称,英国在2020年初发生的COVID-19疫情是世界上规模最大的疫情之一,在病毒基因组抽样中具有代表性。研究人员分析了50887个SARS-CoV-2基因组,其中26181个来自英国第一波感染COVID-19患者的样本,揭示了早期疫情的精细遗传谱系结构。利用大规模的系统发育分析,结合流行病学和旅行数据,研究人员量化了英国SARS-CoV-2遗传谱系的规模、起源和持久性。研究发现英国的SARS-CoV-2谱系超过1000种,英国封锁前引入的病毒谱系往往更大、更分散、更难消除,突出了快速或先发制人的干预措施对减少传播的重要性。在个体水平上,SARS-CoV-2传播的高度异质性似乎已扩展到整个传播谱系,如超过75%的采样病毒属于按规模排名前20%的谱系。文章称,该研究获得的传播结构和动力学提供了一个新的背景,可结合该背景评估在各区域、国家和国际范围内的公共卫生行动计划。
原文链接:https://science.sciencemag.org/content/early/2021/01/07/science.abf2946