信息名称:匹兹堡大学科学家研究SARS-CoV-2病毒的遗传多样性与进化
1.时间:2020年2月21日
2.机构或团队:匹兹堡大学、匹兹堡大学医学中心
3.事件概要:
2月21日,《Infection, Genetics and Evolution》上发表了匹兹堡大学和匹兹堡大学医学中心的题为“Coronavirus epidemic snarls science worldwide”的文章,对86个SARS-CoV-2全基因组和近全基因组(near-complete genomes)进行了遗传分析。
基因组数据下载自GISAID数据库(https://www.GISAID.org/),86个病毒基因组来自中国(50例)、美国(11例)、澳大利亚(5例)、日本(5例)、法国(4例)、新加坡(3例)、英国(2例)、台湾(2例)、韩国(1例)、比利时(1例)、德国(1例)和越南(1例)的SARS-CoV-2感染患者。采用ClustalX2进行了双序列核酸比对,并以China/WHU01/2020/EPI_ISL_406716的基因序列作为参考基因组。
文章发现SARS-CoV-2的编码区和非编码区存在许多突变和缺失。这些分析结果为这种新型冠状病毒的遗传多样性和快速进化提供了证据。
4.附件:
原文链接
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1567134820300915