流行病学研究表明，咖啡消费可能与发生几种神经系统疾病，包括阿尔茨海默病（AD）的风险较低有关。咖啡因是咖啡预防效果的重要候选成分。但是，咖啡中其他成分的贡献尚不清楚。为了阐明这个问题，研究了烘焙咖啡豆对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞中β-分泌酶（BACE1）表达的影响。
咖啡（2％）在24小时后的培养基中Aβ积聚减少至对照水平的80％。因此，BACE1表达在12小时降低至对照水平的70％。使用环己酰亚胺和蛋白酶体抑制剂MG132的实验表明，咖啡通过激活蛋白酶体活性来增强BACE1降解。此外，咖啡激活cAMP依赖性蛋白激酶，并因此激活蛋白酶体26S亚基，以及非ATP酶11（PSMD11）的丝氨酸残基的磷酸化。邻苯二酚，一种被称为儿茶酚或1,2-二羟基苯的强抗氧化剂，在焙烧过程中由绿原酸产生，也通过激活蛋白酶体活性降低BACE1的表达。此外，邻苯二酚降低SH-SY5Y细胞中的Aβ产生。
数据表明，烘焙过程可能对AD中咖啡消费的保护作用至关重要。
