在动物模型中，维持体内代谢平衡的相关生理系统表现出性别差异。研究人员经常使用雄性啮齿类动物作为模型，因为它们比雌性啮齿类动物能够更好的体现代谢疾病。因此，这种已知的性别差异，能够为了解导致不同性别之间代谢性疾病患病率差异的原因提供信息，然而，雌性动物模型却没有得到准确的运用。美国国家卫生研究院（NIH）要求这些缺乏在性别差异研究中使用的模型系统和实验范例方面的专业知识的研究人员和同行评审人员将性别视为临床前研究中的一个生物学变量。在此我们讨论了使用动物模型和细胞研究体内代谢平衡和疾病的性别差异机制时的实验设计和理解。还强调了目前在研究工具和看法上的局限性，这种局限性威胁了基础动物研究中性别差异的研究进展。
