自2003年人类基因组计划完成之后，测序技术发展迅猛。2005年，首款二代测序仪诞生，自此，测序技术的发展势如破竹、高歌猛进！测序读长不断加长，从当初的几十个碱基长度到几百碱基，除此之外，测序通量不断提升、时间不断缩短，测序成本急剧下降，伴随而来的是群体测序时代，以及精准医学时代的开启。
在测序技术发展初期，百家争鸣、百花齐放，各种新技术陆续诞生。对于二代测序而言，主要有两类测序方法，即连接法测序和合成法测序。
连接法测序，英文简称SBL测序，利用1-2个已知碱基标记的探针与目标DNA序列杂交，然后再与下一个标记的探针连接，检测标记探针的信号，从而知道目标DNA的序列信息。SOLiD测序技术便是连接法测序的代表。
合成法测序，英文简称SBS测序，是一种依赖DNA聚合酶来测序的方法；该方法又可以分为循环可逆终止法（cyclic reversible termination，CRT）和单碱基添加（single-nucleotide addition，SNA）法。其中， Illumina测序仪采用的是CRT方法， Roche/454等测序仪采用的是SNA方法。
对于SNA方法，其依赖单个信号来标记每个测序的碱基。因为不能终止反应，所以每次只能允许进一种碱基以防止继续延长，否则如果遇到单碱基重复也会继续读取，增加错误率。
对于CRT方法，拿Illumina测序技术来说，四种dNTP被不同的荧光基团标记，每个循环可结合一个互补的碱基，通过四次拍照和比对，便可以推测出与模板莲所结合的碱基。由于加入的dNTP 3’端羟基进行了封闭性化学修饰，所以每轮反应结束之后，荧光基团需要被切除，以便进行下一个反应。
对于以上这些方法来说，短板也很明显，由于对化学反应本身的错误没有有效的检查和矫正机制，导致了其准确性往往被限制在聚合酶的保真度、信号与序列的线性度、信号检测的灵敏度这几个因素上。2017年11月6日，Nature Biotechnology期刊发表了一篇重磅论文，介绍了由北京大学黄岩谊教授团队开发的一项被称为ECC（ Error-Correction Code）测序的新的测序技术，该技术是基于信息理论来修正错误的高准确度荧光DNA测序方法，将使高通量测序仪的精准度进一步大幅提升。通过实验室样机的测试，测序读长可以达到250bp，其中前200个碱基的准确率100%！
