《研究综述:2020年9月18日》

  • 来源专题:人类遗传资源和特殊生物资源流失
  • 编译者: yanyf@mail.las.ac.cn
  • 发布时间:2020-09-25
  • 欢迎收看2020年9月18日的《研究综述》,这是一篇由Broad研究所的科学家和他们的合作者发表的最新研究的重现快照。

    推进COVID-19诊断

    Julia Joung、Alim Ladha、麻省理工学院麦戈文研究员Omar Abudayyeh和Jonathan Gootenberg、核心研究所成员Feng Zhang及其合作者一直在开发一种基于crispr的COVID-19诊断方法,可以在30分钟到1小时内产生结果。这种被称为STOPCovid的测试,原则上可以以足够低的成本进行日常测试。在《新英格兰医学杂志》(New England Journal of Medicine)上,研究人员描述了他们方案中的新进展,并揭示STOPCovid在402例患者样本中正确检测出93%的已知COVID-19阳性病例。请阅读更多MIT新闻故事。

    慢性淋巴细胞白血病的治疗耐药

    从健康供体移植血液干细胞可以治愈慢性淋巴细胞白血病患者,但仍有一些复发。博士后Pavan Bachireddy,研究所成员Catherine Wu在癌症项目中,和同事们通过对10个病人的癌细胞的遗传、转录组和表观遗传学分析,探索了这种移植后复发的机制。他们在这些患者中发现了两种不同的模式:早期复发,这是由患者细胞中已经存在的耐药性引起的;晚期复发,由存活癌细胞群的迅速变化所驱动。更多信息请访问《科学转化医学》和Bachireddy的推文。

    障碍因素

    肿瘤微环境中的信号可以抑制机体自身的抗肿瘤免疫反应。使用单细胞RNA序列,博士后学者Nandini Acharya和Asaf Madi,核心成员(休假)特拉维夫Regev Vijay Kuchroo协会成员,和协会成员安娜安德森细胞天文台在卡拉曼和他的同事发现在临床前模型和黑色素瘤患者没有回应检查点封锁治疗,糖皮质激素信号导致失调,增加“精疲力尽”CD8 +淋巴细胞。在免疫方面,这项工作表明糖皮质激素抑制剂可以帮助患者对检查点阻断疗法产生反应。

    一半的措施

    细菌可以通过控制其表面多糖链的长度来调节免疫反应。然而,链长对细菌生理和抗生素敏感性的影响尚不清楚。通过研究缩短半乳糖体链分枝杆菌(一种多糖链),协会成员劳拉·基斯林的传染性疾病和微生物项目(IDMP)和合作者发现减少大约一半的链长影响细菌生理和几个细胞属性,包括细胞渗透性、形态、抵抗环境压力和抗生素敏感性。了解更多科学进展。

    驾驶铁

    细胞是如何变得对铁依赖的细胞死亡形式的ferroptosis敏感的?博士后研究人员领导的研究小组仪陇邹,惠特尼·亨利,和艾米丽Ricq,连同相关教员怀特黑德研究所的罗伯特·温伯格和化学生物学的核心成员斯图亚特·施赖伯疗法科学程序,使用全基因组CRISPR-Cas9筛查发现氧化细胞器过氧化物酶体有助于ferroptosis敏感性在人类癌症细胞。通过脂质体分析,他们发现过氧化物酶体合成醚脂质,醚脂质作为脂质过氧化的底物,而脂质过氧化会导致铁作用。在《自然》杂志的报道中,他们指出,降低醚类脂质的癌细胞可以转变为铁铁抵抗状态,而醚类脂驱动其他非癌细胞的铁铁作用。

    研究癌症中的非编码基因组

    为了了解肿瘤发展背后的机制,研究人员需要对编码和非编码基因组的情况有一个准确的了解。在《自然癌症》杂志的一篇综述中,犹他州大学的张晓阳和癌症项目的研究所成员Matthew Meyerson探讨了与癌症相关的非编码变异的已知情况,综述了研究这些变异的方法,并讨论了对它们进行治疗的前景。

    通过饮食控制慢性肾脏疾病

    研究人员还没有充分探索在慢性肾病(CKD)进展和治疗中饮食-微生物群相互作用的机制作用。膳食蛋白增加硫化氢(影响多种生理功能)和肠道细菌产生尿毒症毒素。IDMP的助理成员Wendy Garrett, Lior Lobel和他的同事发现高含硫氨基酸的饮食改变了一种关键的微生物酶——色氨酸酶的活性,减少了尿毒症毒素的产生,减缓了慢性肾病在小鼠体内的进展。据《科学》杂志报道,研究人员得出结论,饮食是控制CKD的一个重要方面。

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    • 来源专题:人类遗传资源和特殊生物资源流失
    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
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    • 欢迎收看2020年12月18日的研究综述,这是布罗德研究所的科学家及其合作者发表的近期研究的重复快照。 神经系统和免疫系统的相互干扰 长期以来,神经系统和免疫系统一直被作为身体中独立的实体进行研究,但研究生卡莉·齐格勒、研究所成员亚历克斯·沙利克(麻省理工学院)及其同事发现了两者之间的直接细胞相互作用:刺激小鼠淋巴结并调节其活动的痛觉神经元。他们发现,在脊髓背根神经节的数千个感觉细胞中,只有少数几个参与了单个淋巴结的这种耦合。神经元对淋巴结的变化作出反应,当被激活时,导致淋巴结细胞的基因表达变化。请阅读《细胞》和《大故事》。 Paralog pair证明了靶向癌症治疗的前景 失去关键基因的癌细胞通常依赖于同源基因(具有共同遗传祖先和相似功能的基因)来维持基本的通路。在《细胞报告》中,Jasper Neggers, Brent Paolella,研究所科学家Francisca Vazquez,助理成员Andrew Aguirre (DFCI),以及其他广泛癌症项目的癌症依赖图小组成员揭示,三分之一的癌症可能依赖于VPS4A或VPS4B的旁谱。缺乏SMAD4或CDH1肿瘤抑制基因的细胞系通常也会丢失其中一个同源基因,使它们依赖于另一个同源基因。针对剩余相似物的方法可能为治疗发展带来希望。了解更多的故事和视频与negggers和Paolella。 发现基因变异和肝硬化的风险 与大多数其他常见疾病相比,通过全基因组关联研究(GWAS),很少有遗传变异被确定为肝硬化风险。康纳·埃姆丁、医学和人群遗传学项目的副主任阿米特·赫拉和他的同事们使用了一种多性状GWAS技术——一种由帕特里克·特利和他的同事们在Broad开发的技术——鉴定了12种影响肝硬化的遗传变异。作者基于从所有12个变异中收集到的信息构建了一个多基因分数。得分最高的人患肝硬化的风险增加了3倍以上,肥胖或因基因-环境相互作用而增加酒精摄入量的风险明显更高。更多信息请访问《胃肠病学》和这篇微博。 细胞应激信号驱动肝脏疾病 肝细胞内质网应激在导致胰岛素抵抗和糖尿病发展的应激信号网络中起关键作用。尽管内质网应激的机制基础已经在细胞和分子水平上进行了研究,但在组织和器官水平上,对细胞与细胞之间的沟通和协调反应的潜在作用了解有限。通过细胞培养和小鼠模型,代谢项目的合作成员Gokhan Hotamisligil、Amir Tirosh (HSPH)和同事发现,在肥胖中,一种蛋白质Cx43允许内质网应激信号在肝脏细胞间传播,导致脂肪性肝病和代谢改变。请阅读《细胞代谢》。 髓,改建 髓磷脂是一种围绕神经细胞的绝缘鞘,它能使电脉冲有效传递,是脊椎动物神经系统的基本结构。随着时间的推移和对神经元活动的反应,这种组织可以被重塑,但目前还不清楚这些动态是否在不同类型的神经元之间有所不同。由哈佛大学杨宋敏(Sung Min Yang)、麻省理工学院艾莉·内迪维(Elly Nedivi)和斯坦利精神病学研究中心成员宝拉·阿洛塔(Paola Arlotta)领导的一个研究小组在多种条件下对成年小鼠视觉皮层神经元中的髓鞘进行了成像。数据表明,不同种类的神经元以不同的方式调整髓磷脂重塑,以响应感官体验。学习更多的科学知识。
  • 《研究综述:2020年10月9日》

    • 来源专题:人类遗传资源和特殊生物资源流失
    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间:2020-10-13
    • 欢迎收看2020年10月9日的《研究综述》(Research Roundup),这是一篇由Broad Institute的科学家及其合作者发表的最新研究的重现快照。 抗疟疾的新方法 一项新的研究发现,有前途的抗疟化合物还可以杀死肠内寄生虫隐孢子虫(Cryptosporidium)。隐孢子虫是导致儿童腹泻和死亡的主要原因,目前无法治愈。这项工作由宾夕法尼亚大学的Boris Streipen、佛蒙特大学的Christopher Huston和Broad化学生物学和治疗学科学项目的alum Eamon Comer领导。此前发现的双环氮杂丁以一种新的方式杀死疟疾寄生虫,在四天每天一次的治疗后,可以消除小鼠的隐孢子虫感染。在《科学转化医学》和一份新闻稿中描述,这项研究可能有助于为开发迫切需要的治疗方法铺平道路。 记住 寻找的分子根记忆存储在大脑中,Asaf马可(麻省理工学院),高级会员Li-Huei蔡的单元电路程序和Picower研究所学习和记忆在麻省理工学院,和他的同事们分析了表观基因组印迹细胞基因组结构和三维,记忆形成神经元,通过学习改变。在老鼠模型中,激活的神经元被永久标记,他们发现记忆编码增加了染色质的可及性,而没有基因表达的改变。记忆的巩固重组了大的染色质片段,记忆的回忆导致新的启动子和增强子的相互作用,并改变突触室中蛋白质合成相关基因的表达。更多信息请阅读《自然神经科学》。 基于脂蛋白的心脏病风险评分 高水平的脂蛋白(a)会增加患心脏病的风险,但医生很少测量这种脂蛋白的水平。来访的学生马克(英属哥伦比亚大学),一条对付责难者Pradeep Natarajan,准会员的程序在医学和种群遗传学和马萨诸塞州总医院,和他的同事使用43脂蛋白(a)基因变异的数据来自370000多个英国生物库参与者来计算一个新的遗传风险评分预测能力匹配的脂蛋白(a)血液心脏病风险的测量。这种风险评分可以帮助医生识别高风险患者,特别是那些没有通过传统血液检测的患者。更多信息请参阅麻省总院发布的JAMA Cardiology和Natarajan的推文。 该模型小鼠 C9ORF72的六核苷酸重复扩增(一种DNA突变)是肌萎缩性脊髓侧索硬化症和额颞叶痴呆最常见的遗传原因。对这种突变的不同转基因小鼠模型的初步研究,在生存和运动表型方面得出了相互矛盾的结果。斯坦利精神病学研究中心的研究所成员凯文·埃根,丹尼尔·莫德斯和他的同事对两组独立的具有相同突变的转基因小鼠进行了广泛的表型分析,以评估它们在神经退行性疾病研究中的应用。他们在《神经元》杂志上写道,在这两个队列中,他们都没有报告存活率、运动功能或神经退行性变方面的可重复性异常。