《12月28日_Eurofins推出新冠病毒全基因组测序服务以加强对病毒突变的鉴定》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2021-02-03
  • Businesswire网站12月28日消息称,Eurofins基因组学公司推出了成本更低的新一代SARS-CoV-2测序服务,可提供病毒全基因组序列。SARS-CoV-2变体数量不断增加,使得病毒株的毒力、传染性和表位发生改变,因而需要对病毒全基因组进行识别和追踪。SARS-CoV-2全基因组测序可在早期阶段识别突变株并发现新风险,规避免疫或疫苗功效变化。
    Eurofins的复杂生物信息学流水线可对连续的SARS-CoV-2分离序列进行组装和比较,并提供结论性解释报告。Eurofins正在向公共医疗机构免费提供部分测序能力,这些公共医疗机构没有紧急预算来检测目前在英国快速传播的VUI2020-12/01毒株。
    原文链接:https://www.businesswire.com/news/home/20201228005193/en/

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    • 编译者:zhangmin
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    • Biospace网站3月11日消息称,BPS生物科学公司推出了SARS-COV-2突变株的独特的假型病毒,扩大了其冠状病毒产品组合。研究人员已经开发了一系列以刺突蛋白为包膜糖蛋白的刺突蛋白假型慢病毒。这些假型病毒含有一个报告基因(萤火虫荧光素酶或增强型GFP)。当与表达ACE2受体的细胞系一起孵育时,可以通过测量荧光素酶或eGFP活性,检测出刺突蛋白介导的假型病毒进入靶细胞的情况。因此,刺突蛋白假病毒提供了一种细胞检测方法,不仅可以监测病毒与ACE2受体的附着情况,还可以监测膜融合和细胞进入的情况。 目前,BPS的假型病毒产品包括原始的野生型(在武汉首次发现)序列、B.1.1.7(在英国首次发现)、B.1.351(在南非首次发现)、P.1(在巴西首次发现)变体、高度保守的D614G突变、在巴西首次发现的变体的RBD(受体结合域)中存在的3个突变(K417T,E484K,N501Y),这些假型病毒产品可以用于研究中和抗体的结合位点和作用机制。BPS还提供一些突变体重组刺突蛋白(RBD、S1和全三聚体)和突变体刺突蛋白检测试剂盒,采用方便的96孔或384孔。这些基于比色、化学发光或TR-FRET的检测方法是筛选和剖析ACE2与刺突蛋白相互作用抑制剂的理想选择。BPS开发的冠状病毒研究工具和服务组合包括ACE2受体和TMPRSS2表达细胞系以及针对3CL、PLPro、TMPRSS2、弗林蛋白酶、RdRP和其他SARS-CoV-2关键靶点的独特检测方法。 原文链接:https://www.biospace.com/article/bps-bioscience-introduces-pseudovirions-of-mutant-strains-of-sars-cov-2-for-cellular-assays/?keywords=COVID-19
  • 《德国加强对病毒突变的监测》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2021-01-20
    • 18日,德国拜仁州加米施-帕滕基兴医院发现一种此前未知的新冠病毒变体。目前尚不清楚病毒突变的来源以及它是否更具传染性。而为了防止更具传染性的新冠病毒突变进一步蔓延,德国联邦卫生部决定加强对新冠病毒突变的监测,未来将对所有核酸检测阳性样本的至少百分之五进行基因组测序。   近日,德国拜仁州加米施-帕滕基兴医院的工作人员发现,在其内部新冠测试中,以前的阳性测试结果有所变化,借助特殊的实验室设备研究人员发现了病毒涂片中的不规则现象。因此,来自三名受影响患者的样本被送到柏林夏里特医院进行进一步调查。初步研究确认了此前的推断,这实际上是迄今为止未知的病毒突变。   德国著名病毒学家,夏里特医院病毒学研究所所长克里斯蒂安·德罗斯滕教授领导的研究人员正在努力弄清该病毒变体的特征,以阐明导致此变化的原因。目前尚不清楚病毒突变的来源以及它是否更具传染性。预计将于一月底取得具体结果。   加米施-帕滕基兴医院强调,暂时没有理由恐惧这一病毒突变。它仅仅是一个新的变体,并不意味着具有更大的传染性。自新冠疫情开始以来,全世界已发现12000多种病毒序列的变化。最近的事实证明,在英国和南非出现的变种更具侵略性和传染性。但这些变异和突变都尚未导致更高的死亡率。另外,也没有降低已知疫苗的保护作用。   另一方面,德国总理默克尔上周特别强调,必须高度警惕新冠病毒突变带来的病例暴增,如果像在爱尔兰发生的那样,将会使德国的卫生系统不堪重负。德国传染病疾控机构罗伯特·科赫研究所所长威勒教授则表示,与英国和丹麦不同,德国目前还没有对新冠病毒突变进行系统的监测。因此,无法判断病毒突变的扩散程度。   为了防止病毒突变进一步蔓延,德国联邦卫生部于1月18日宣布加强对病毒突变的监测,目标是检查至少百分之五的阳性样本中是否存在基因突变。卫生部部长施潘说:“我们希望更好地了解在德国流行的病毒变种。”德国的实验室为此进行的每一次基因组测序,包括将检测数据和报告发送给罗伯特·科赫研究所或夏里特医院病毒学研究所,将获得联邦政府220欧元的资助。假设每天有25000例新感染病例,到2021年7月31日将花费约5600万欧元。