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《3月11日_BPS推出新冠突变株的假型病毒用于细胞检测》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2021-03-15

  • Biospace网站3月11日消息称，BPS生物科学公司推出了SARS-COV-2突变株的独特的假型病毒，扩大了其冠状病毒产品组合。研究人员已经开发了一系列以刺突蛋白为包膜糖蛋白的刺突蛋白假型慢病毒。这些假型病毒含有一个报告基因（萤火虫荧光素酶或增强型GFP）。当与表达ACE2受体的细胞系一起孵育时，可以通过测量荧光素酶或eGFP活性，检测出刺突蛋白介导的假型病毒进入靶细胞的情况。因此，刺突蛋白假病毒提供了一种细胞检测方法，不仅可以监测病毒与ACE2受体的附着情况，还可以监测膜融合和细胞进入的情况。
    目前，BPS的假型病毒产品包括原始的野生型（在武汉首次发现）序列、B.1.1.7（在英国首次发现）、B.1.351（在南非首次发现）、P.1（在巴西首次发现）变体、高度保守的D614G突变、在巴西首次发现的变体的RBD（受体结合域）中存在的3个突变（K417T，E484K，N501Y），这些假型病毒产品可以用于研究中和抗体的结合位点和作用机制。BPS还提供一些突变体重组刺突蛋白（RBD、S1和全三聚体）和突变体刺突蛋白检测试剂盒，采用方便的96孔或384孔。这些基于比色、化学发光或TR-FRET的检测方法是筛选和剖析ACE2与刺突蛋白相互作用抑制剂的理想选择。BPS开发的冠状病毒研究工具和服务组合包括ACE2受体和TMPRSS2表达细胞系以及针对3CL、PLPro、TMPRSS2、弗林蛋白酶、RdRP和其他SARS-CoV-2关键靶点的独特检测方法。
    原文链接：https://www.biospace.com/article/bps-bioscience-introduces-pseudovirions-of-mutant-strains-of-sars-cov-2-for-cellular-assays/?keywords=COVID-19

  • 原文来源：https://www.biospace.com/article/bps-bioscience-introduces-pseudovirions-of-mutant-strains-of-sars-cov-2-for-cellular-assays/?keywords=COVID-19
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  • 《12月28日_Eurofins推出新冠病毒全基因组测序服务以加强对病毒突变的鉴定》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-02-03
    • Businesswire网站12月28日消息称，Eurofins基因组学公司推出了成本更低的新一代SARS-CoV-2测序服务，可提供病毒全基因组序列。SARS-CoV-2变体数量不断增加，使得病毒株的毒力、传染性和表位发生改变，因而需要对病毒全基因组进行识别和追踪。SARS-CoV-2全基因组测序可在早期阶段识别突变株并发现新风险，规避免疫或疫苗功效变化。 Eurofins的复杂生物信息学流水线可对连续的SARS-CoV-2分离序列进行组装和比较，并提供结论性解释报告。Eurofins正在向公共医疗机构免费提供部分测序能力，这些公共医疗机构没有紧急预算来检测目前在英国快速传播的VUI2020-12/01毒株。 原文链接：https://www.businesswire.com/news/home/20201228005193/en/
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  • 《化亲和力为武器 假体蛋白能抑制新冠病毒及其突变株》
    • 来源专题：中国科学院病毒学领域知识资源中心
    • 编译者：malili
    • 发布时间：2020-12-02
    • 新冠疫情发生以来，科学家一直致力于了解病毒入侵机理，研究破解之道。疫苗以及抗体作为预防和治疗新冠肺炎的重要手段，目前已经取得相关进展。除了这些手段之外，是否还有其他方法能有效遏制新冠病毒？ 11月12日，西湖大学党波波团队、周强团队与复旦大学基础医学院陆路团队在《细胞研究》联合发表最新成果。他们基于对新冠病毒受体ACE2的设计与改造，构建了多种ACE2三聚体蛋白。联合研究团队制造了一个ACE2假体蛋白“迷惑”病毒，其对病毒的“吸引力”比ACE2本身要高1000倍以上，极大提高了病毒抑制能力。 让病毒优先与假体蛋白结合 ACE2的中文名叫“血管紧张素转化酶2”，是人体内一种参与血压调节的蛋白。其主要生理作用是促进血管紧张素的成熟，在肺、心脏、肾脏和肠道广泛存在。 此前研究发现，新冠病毒感染人体细胞的关键在于冠状病毒的刺突蛋白“劫持”了原本控制血压的ACE2，通过与它的结合入侵人体。 “既然ACE2蛋白是病毒入侵人体的闸门，是否能设计出一个ACE2假体蛋白，用诱敌战术达到抑制病毒的效果？”党波波介绍说，研究表明，新冠病毒刺突蛋白以三聚体形态存在，就像三根手指被胶水黏在一起。“因此我们设想构建一个ACE2三聚体蛋白实现3对3或者至少2对2的结合，使两者的结合更加牢靠。” 为此，研究人员首先详细分析了新冠病毒刺突蛋白本身的结构，根据刺突蛋白的结构来假设其与ACE2三聚体蛋白结合的方式，从而建立两者结合的模型。随后他们根据模型选取了将ACE2单体构建成三聚体的不同链接模块以及三聚化模块，以此构建多种不同的ACE2三聚体蛋白。 经过一系列设计改造尝试，研究人员得到了一个三聚体蛋白T-ACE2。实验结果显示，这一T-ACE2蛋白与新冠病毒刺突蛋白的亲和力，比ACE2单体与刺突蛋白的亲和力提高了1000多倍。 “亲和力高了，病毒就会优先结合T-ACE2，从而失去结合细胞表面ACE2的能力，因此T-ACE2具有了非常强的病毒抑制活性。”党波波补充道，在设计之初，团队并不确定ACE2三聚体蛋白能否达到理想的效果。“诱敌战术奏效，这对于理解刺突蛋白与受体蛋白ACE2的相互作用应该有着重要的启示。” 还能抑制其他冠状病毒 随着疫情发展常态化、病毒变异的积累，已有的蛋白抑制剂（例如抗体）对于新冠病毒及其潜在突变株的作用面临考验。开发能够广谱抑制新冠病毒及其突变株的抑制剂，将成为应对新冠病毒变异及疫情常态化的有效手段。 “所谓抗体，指一类特定的蛋白。团队改造后的ACE2和抗体是一个平行的概念，他们都从属于蛋白抑制剂。”党波波介绍说，二者相当于在完成同项工作的不同工种。 记者了解到，设计改造假体蛋白“迷惑”病毒的做法，在病毒研究里面以前有提出过，比如非典暴发时期，已有科学家提出直接用受体ACE2去抑制病毒，但是因为ACE2本身对病毒亲和力较低，抑制效果比较一般。 “在ACE2三聚体蛋白设计改造过程中，我们尝试了很多种方案后才找出最优解。”党波波说，为了最大程度保留改造后蛋白对于病毒及其突变株的广谱适用性，研究人员选择完全保留天然ACE2的序列，因为基于天然ACE2序列的改造可以适应多种突变病毒。在本研究中，研究人员也证实T-ACE2对新冠病毒、8种不同天然新冠突变株、非典病毒以及两种新冠类似病毒均有很强的抑制活性。 由于新冠病毒侵染人体细胞需要通过受体蛋白ACE2这一“通用渠道”实现，基于受体蛋白ACE2设计的抑制剂，相比抗体对新冠病毒突变株有着更广谱的抑制能力。此外，基于受体ACE2设计改造的蛋白，也将很有可能用于抑制新发或者再次出现的其他新冠类似病毒。 “不过T-ACE2作为病毒抑制蛋白的临床应用前景尚待以后更深入的实验验证。”党波波说，T-ACE2因为和病毒刺突蛋白有非常强的亲和力，还有望被用于病毒检测方法的开发。
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