tRNA分子含有密集、丰富的修饰,影响tRNA结构、稳定性、mRNA解码和tsRNA的形成。tRNA修饰和相关酶对环境线索有反应,并与一系列生理和病理过程有关。然而,缺乏可用于挖掘和分析这些动态变化的tRNA修饰的资源。在这项研究中,我们建立了tModBase(
https://www.tmodbase.com/),用于破译tRNA修饰剖面的景观。我们分析了使用第二代和第三代测序技术生成的103个数据集,并说明了十个物种中tRNA修饰位点的错误合并和终止信号。因此,我们系统地展示了不同组织/细胞系的修饰特征,并总结了tRNA相关人类疾病的特征。通过整合来自32种癌症的转录组数据,我们开发了分析tRNA修饰酶和RNA修饰酶、1442个tRNA衍生小RNA(tsRNA)的表达和654个DNA变异之间的关系的新工具。我们的数据库将提供有关tRNA修饰特征及其参与的生物途径的新见解。