《Cell | IKAROS 在多个尺度上组装了谱系特异性3D 基因组组织》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2023-11-27
  • 2023年11月22日,哈佛医学院等机构的研究人员在Cell 在线发表题为Lineage-specific 3D genome organization is assembled at multiple scales by IKAROS的研究论文。

    由粘附素和 CTCF 之间的相互作用产生的染色质组织的通用水平足以限制调节元件之间的混杂相互作用,但需要取代这些约束的谱系特异性染色质组装来配置基因组以指导驱动忠实谱系进展的基因表达变化。

    B 细胞前体功能丧失方法显示 IKAROS 组装跨兆碱基距离的相互作用,为淋巴发育做准备。来自 IKAROS 结合的增强子的相互作用超越了 CTCF 施加的边界,以组装建立在较小的不变拓扑域骨干上的谱系特异性调节单元。上皮细胞功能的获得证实了 IKAROS 在多个尺度上重新配置染色质结构的能力。尽管基因组编辑所需的 Igκ 基因座的压缩代表了淋巴细胞特有的 IKAROS 的功能,但是预先配置基因组以支持谱系特异性基因表达和抑制谱系外基因的激活的更一般的功能提供了谱系限制的范例。

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