染色体构象是多细胞生物基因调控的重要特点。然而，细胞分化过程中的增强子与启动子之间的接触变构作用仍然很难去理解。为了解决这个问题，在表皮分化过程中利用全基因组范围的启动子来捕捉Hi-C（CHi-C）。目前，与分化诱导基因相关的两类增强子与启动子已经被研究验证。第一类增强子与启动子（获取类），能够在与增强子获得H3K27ac激活标记的同时，在分化过程中增加接触强度。第二类增强子与启动子（稳定类），预先由H3K27标记且在未分化的细胞内构成。其中，第二类（稳定类）与典型构象的调控蛋白有关，而第一类（获取类）则与其无关，这就意味着二者之间存在不同的接触形成与调控机制。在表皮分化过程中，通过对稳定增强子的分析研究，证明了其可以作为一种结构性表达的有谱系限制的ETS同源遗传转录因子EHF。此外，不论在干细胞中是哪种类型的接触，其结果都表明谱系特异性染色质结构会在组织祖细胞中建立并且在末端分化时的进一步重塑变构。
