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《Gotham成立 表观转录组学进入转化阶段 》

  • 来源专题：人类遗传资源和特殊生物资源流失
  • 编译者： yanyf@mail.las.ac.cn
  • 发布时间：2018-10-12

  • 10月11日，纽约的Gotham Therapeutics获得5400万美元A轮投资，正式挂牌成立。Gotham的技术平台是表观转录组学（epitranscriptomics）、即调控RNA的化学修饰。Gotham主要关注一种叫做m6A(6-甲基腺苷)的常见mRNA修饰，这个修饰在RNA代谢中起到关键作用、与多种疾病相关。这是继今年五月Accent Therapeutics之后第二家成立的表观转录组学公司，显示这个技术已经到了转化阶段。 药源解析 纽约一直希望成为一个与棒球宿敌波士顿比肩的生物技术中心，但尽管有哥伦比亚、斯隆、洛克菲勒、康奈尔医学院这样一流大学和医院但纽约地区除了再生元外生物技术公司相对默默无闻，Gotham是该地区今年最大的A轮融资也说明这还是生物技术的发展中地区。Gotham是纽约诸多绰号中的一个，源自一个英国传说中的一个叫做Gotham的小城，该城居民听说国王要从这个地区经过所以装疯卖傻令国王不敢接近。当然现在纽约急需生物技术国王光临，已经准备10亿美元打造宏观设施。

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    • 2023年9月28日，美国洛克菲勒大学曹俊越团队在Cell发表题为Tracking cell-type-specific temporal dynamics in human and mouse brains的文章。研究人员结合新生细胞标记和组合索引单细胞测序技术(single-cell combinatorial indexing)，开发了一项单细胞组学新方法TrackerSci，用于表征体内增殖祖细胞的转录组和开放染色质组。 使用TrackerSci，研究了不同年龄阶段和阿尔茨海默病模型小鼠的全脑新生细胞，揭示了多样的祖细胞类型及其表观遗传特征，量化了与衰老相关的细胞类型特异性增殖和分化的变化动态，并鉴定衰老相关调控基因。此外，该研究扩展至老年人脑，研究了祖细胞跨物种间的保守特征，并分析了脑区特定的细胞分化动态。 本文内容转载自“小柯生命”微信公众号。 原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/nHq-ctPZ7g0QwyXiChkCeg
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    • 自然界中昆虫通常可以通过在自身激素调节下的滞育状态，以克服度过不利于其生存的季节。在这一状态中，昆虫的所有活动全部停止，其生长发育也处于滞缓状态，新陈代谢活动更是被调控抑制，这也就增加了昆虫个体对严峻环境压力的耐受性。于是，昆虫将在此种较为僵式的生理状态下度过“滞育状态”时期。在各类文献中，这种“滞育状态”的说法有很多版本，但作为一个完整的概念描述时却被批评过多地人为因素。在这里，我们向您介绍一种果蝇的转录谱特征研究结果，通过使用定向微阵列技术，能够扫描检测果蝇中1042的位点基因。并且，该研究通过短日光周期信号使发育成熟的果蝇三龄幼虫进入滞育发育状态。此外，果蝇幼虫的滞育发育状态过程将被检测研究。在分析转录谱特征的渐变过程中，我们可以很容易地区分果蝇幼虫在与诱导/启动，维持，冷驯化，冷感染或与光周期信号相关的明显的滞育发育阶段。相应地，每个阶段的特征是特定基因表达的结果，这也在一定程度上支持了滞育发育概念的生理相关性。此外，我们更详细地解释了被认为对于滞育调节至关重要的几种信号传导途径的元素在转录水平的变化。研究发现，滞育终止阶段与刺激直接发育的几个阳性因子的转录水平的增强相关（20羟基蜕皮激素途径：Ecr，Shd，Broad; Wnt信号通路：笼状体，基因蛋白），这些因素在一些阴性因子（胰岛素信号通路：Ilp8，PI3k，Akt; 雷帕霉素途径的靶标：Tsc2和4EBP; Wnt信号通路：突触）上调的情况下会被所抵消。于是我们推测，这种激素的上调可能代表与终止滞育程序相关的早期步骤。
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