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《3月31日_阻止SARS-CoV-2刺突蛋白与人类ACE2结合的肽段的计算设计》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-04-02

  • 1.时间：2020年3月31日
    2.机构或团队：美国密歇根大学
    3.事件概要：
    3月31日，bioRxiv预印本平台发表了来自美国密歇根大学研究团队的题为“Computational Design of Peptides to Block Binding of the SARS-CoV-2 Spike Protein to Human ACE2”的文章。该文章指出，能够阻断SARS-CoV-2与hACE2结合的分子可能会阻止病毒进入人体细胞，并作为有效的抗病毒药物。基于这个想法，该研究设计了一系列可以在计算实验中与SARS-CoV-2 RBD牢固结合的肽。
    研究人员首先用甘氨酸连接剂将hACE2的两个片段（a.a.a.22-44和351-357）连接，构建了一个31-mer多肽支架，然后重新设计多肽序列，以增强其与SARS-CoV-2 RBD的结合亲和力。该研究指出，与同类的计算设计型研究相比，该研究的蛋白质设计打分函数EvoEF2准确性更高；与自然型相比，顶层设计的多肽结合剂对hACE2的结合力要强得多。该研究认为，广泛而详细的计算分析支持了设计的结合剂的高合理性，不仅重述了关键的原生结合相互作用而且还引入了新的有利的相互作用来增强结合。
    *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
    4.附件：
    原文链接https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.28.013607v1

  • 原文来源：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.28.013607v1
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    • 编译者：hujm
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    • 3月31日，bioRxiv预印本平台发表了来自美国密歇根大学研究团队的题为“Computational Design of Peptides to Block Binding of the SARS-CoV-2 Spike Protein to Human ACE2”的文章。该文章指出，能够阻断SARS-CoV-2与hACE2结合的分子可能会阻止病毒进入人体细胞，并作为有效的抗病毒药物。基于这个想法，该研究设计了一系列可以在计算实验中与SARS-CoV-2 RBD牢固结合的肽。 研究人员首先用甘氨酸连接剂将hACE2的两个片段（a.a.a.22-44和351-357）连接，构建了一个31-mer多肽支架，然后重新设计多肽序列，以增强其与SARS-CoV-2 RBD的结合亲和力。该研究指出，与同类的计算设计型研究相比，该研究的蛋白质设计打分函数EvoEF2准确性更高；与自然型相比，顶层设计的多肽结合剂对hACE2的结合力要强得多。该研究认为，广泛而详细的计算分析支持了设计的结合剂的高合理性，不仅重述了关键的原生结合相互作用而且还引入了新的有利的相互作用来增强结合。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
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  • 《3月11日_一种ACE2诱饵可与SARS-CoV-2变体高度结合并中和活病毒》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-03-15
    • 据businesswire网站3月11日消息，临床阶段免疫治疗公司ImmunityBio（IBRX）宣布正在开发一种新型的hAd5 ACE2诱杀治疗性疫苗，以中和SARS-CoV-2病毒，包括E484K和N501Y突变。该公司在第28届逆转录病毒和机会感染会议（CROI）上以口头报告的形式介绍了结果，并在预印本服务器bioRxiv中公开了对这些变体具有高结合亲和力的积极发现，题为：“A recombinant ACE2 triple decoy that traps and neutralizes SARS-CoV-2 shows enhanced affinity for highly transmissible SARS-CoV-2 variants”。 hAd5 ACE2诱饵候选物基于修饰的血管紧张素转化酶2（ACE2）受体，该受体可与呼吸道细胞上的ACE2竞争结合SARS-CoV-2病毒。ACE2诱饵会捕获病毒，阻止其感染细胞并促进病毒从体内清除。ImmunityBio先前在12月报告的先进分子动力学模拟功能可用于设计ACE2诱饵，因此与细胞上发现的天然ACE2相比，它对病毒（包括SARS-CoV-2变体）的亲和力更高。 在CROI上的题为“A SARS-CoV-2 Neutralizing ACE2 Decoy Shows High Affinity for N501Y and L452R Variants”的报告着重强调了ImmunityBio开发的重组蛋白质构建体，该构建体可充当诱饵ACE2受体，将与呼吸道细胞上的ACE2竞争，以结合SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域（RBD）。一种有效的、高亲和力的诱饵可能被用于COVID-19的治疗，通过击败人类ACE2受体与SARS-CoV-2 的RBD结合，从而抑制体内感染事件。它也有可能被用作一种预防措施，可作为疫苗接种的一种补充，用于感染高危人群。 原文链接：https://www.businesswire.com/news/home/20210311005349/en
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