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《3月10日_两种RT-qPCR方法在自动化工作流程中检测SARS-CoV-2的灵敏性和特异性》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-03-12

  • 1.时间：2020年3月10日

    2.机构或团队：巴西Sabin医疗诊断公司

    3. 事件概要：

    medRxiv预印版于3月10日发表了巴西Sabin 医疗诊断公司发表的论文“Analytical sensibility and specificity of two RT-qPCR protocols for SARS-CoV-2 detection performed in an automated workflow”。文章称制定可靠的SARS-CoV-2实验室诊断成为必须，以便及早识别、隔离和为患者提供最佳的护理。呼吸道分泌物的RT-qPCR检测通常用于检测急性呼吸道感染中的致病病毒。用于检测SARS-CoV-2的RT-qPCR实验方法已有报道，这些实验方法的验证被认为是COVID-19的关键知识缺口，特别是大量检测时。

    研究人员调查了在全自动平台上对SARS-CoV-2进行定性检测的两个暂行的RT-qPCR方案的分析灵敏性和特异性。研究人员发现在其条件下，N1和RdRP（修饰的）基因对RNA靶标显示出最高的分析灵敏度。原始浓度的E区域被认为是第三位确诊分析。综上所述，N1、RdRP(优化)和E基因在研究人员针对COVID-19病毒的自动RT-qPCR工作流程中表现出了适当的分析灵敏性和特异性，E基因的灵敏性比其他基因至少低4倍。这项研究强调了在向人群提供检测之前，对实验室检测进行局部验证的重要性。利用合成的RT-qPCR靶点研究自动化工作流程中新的检测诊断参数，是为即将到来的威胁做好准备的一种快速、简单、有效的方法。

    *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。

    4.附件

    原文链接：https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.07.20032326v1

  • 原文来源：https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.07.20032326v1
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    • medRxiv预印版于3月10日发表了巴西Sabin 医疗诊断公司发表的论文“Analytical sensibility and specificity of two RT-qPCR protocols for SARS-CoV-2 detection performed in an automated workflow”。文章称制定可靠的SARS-CoV-2实验室诊断成为必须，以便及早识别、隔离和为患者提供最佳的护理。呼吸道分泌物的RT-qPCR检测通常用于检测急性呼吸道感染中的致病病毒。用于检测SARS-CoV-2的RT-qPCR实验方法已有报道，这些实验方法的验证被认为是COVID-19的关键知识缺口，特别是大量检测时。 研究人员调查了在全自动平台上对SARS-CoV-2进行定性检测的两个暂行的RT-qPCR方案的分析灵敏性和特异性。研究人员发现在其条件下，N1和RdRP（修饰的）基因对RNA靶标显示出最高的分析灵敏度。原始浓度的E区域被认为是第三位确诊分析。综上所述，N1、RdRP(优化)和E基因在研究人员针对COVID-19病毒的自动RT-qPCR工作流程中表现出了适当的分析灵敏性和特异性，E基因的灵敏性比其他基因至少低4倍。这项研究强调了在向人群提供检测之前，对实验室检测进行局部验证的重要性。利用合成的RT-qPCR靶点研究自动化工作流程中新的检测诊断参数，是为即将到来的威胁做好准备的一种快速、简单、有效的方法。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。
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  • 《5月23日_广东省人民医院等团队研发了一种可快速、灵敏检测SARS-CoV-2感染的环介导等温扩增方法》
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    • 编译者：xuwenwhlib
    • 发布时间：2020-05-24
    • 信息名称：广东省人民医院等团队研发了一种可快速、灵敏检测SARS-CoV-2感染的环介导等温扩增方法 1.时间：2020年5月23日 2.机构或团队：广东省人民医院（广东省医学科学院）、华南理工大学、广东省第二人民医院、北京金匙基因科技有限公司 3.事件概要： 5月23日，medRxiv发表了题为“Development and clinical application of a rapid and sensitive loop-mediated isothermal amplification test for SARS-CoV-2 infection”的文章。 SARS-CoV-2的爆发迫切需要灵敏、方便的COVID-19诊断方法以保证患者的及时治疗。本文中开发和验证了一种新的逆转录环介导等温扩增（RT-LAMP）方法，可在合格的实验室和护理点检测SARS-CoV-2。 研究方法为在2020年1月26日至4月8日期间，从两家医院招募了疑似COVID-19和密切接触患者。采集呼吸样本，用LAMP方法进行检测，并与RT-qPCR结果进行比较。对这两种方法之间不一致的样本进行下一代测序确认。此外，还检测了无症状COVID-19携带者和其他呼吸道病毒感染患者的RT-LAMP。 结果共收集了129例（329个鼻咽拭子）和76例（152个鼻咽拭子和痰样本）的独立样本。RT-LAMP方法的准确性（总敏感性和特异性分别为88.89%和99.00%；阳性和阴性预测值分别为94.74%和97.78%）和诊断有用性（阳性和阴性似然比为88.89和0.11）已被验证。与RT-qPCR的SARS-CoV-2筛查相比，RT-LAMP表现出更高的灵敏度（88.89%比81.48%）和一致性（kappa为0.92），并只需恒温加热和目测检查。从拿到样品到获得结果，RT-LAMP所需时间小于1小时。进一步分析表明，RT-LAMP对无症状患者也是可行的，并且不会与其他呼吸道病原体感染发生交叉反应。 文章认为此RT-LAMP检测方法为SARS-CoV-2感染提供了一种快速、灵敏、直观的检测方法，有助于公共领域的COVID-19检测和医院推广。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接 https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.05.20.20108530v1
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