《5月23日_广东省人民医院等团队研发了一种可快速、灵敏检测SARS-CoV-2感染的环介导等温扩增方法》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: xuwenwhlib
  • 发布时间:2020-05-24
  • 信息名称:广东省人民医院等团队研发了一种可快速、灵敏检测SARS-CoV-2感染的环介导等温扩增方法
    1.时间:2020年5月23日
    2.机构或团队:广东省人民医院(广东省医学科学院)、华南理工大学、广东省第二人民医院、北京金匙基因科技有限公司
    3.事件概要:
    5月23日,medRxiv发表了题为“Development and clinical application of a rapid and sensitive loop-mediated isothermal amplification test for SARS-CoV-2 infection”的文章。
    SARS-CoV-2的爆发迫切需要灵敏、方便的COVID-19诊断方法以保证患者的及时治疗。本文中开发和验证了一种新的逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)方法,可在合格的实验室和护理点检测SARS-CoV-2。
    研究方法为在2020年1月26日至4月8日期间,从两家医院招募了疑似COVID-19和密切接触患者。采集呼吸样本,用LAMP方法进行检测,并与RT-qPCR结果进行比较。对这两种方法之间不一致的样本进行下一代测序确认。此外,还检测了无症状COVID-19携带者和其他呼吸道病毒感染患者的RT-LAMP。
    结果共收集了129例(329个鼻咽拭子)和76例(152个鼻咽拭子和痰样本)的独立样本。RT-LAMP方法的准确性(总敏感性和特异性分别为88.89%和99.00%;阳性和阴性预测值分别为94.74%和97.78%)和诊断有用性(阳性和阴性似然比为88.89和0.11)已被验证。与RT-qPCR的SARS-CoV-2筛查相比,RT-LAMP表现出更高的灵敏度(88.89%比81.48%)和一致性(kappa为0.92),并只需恒温加热和目测检查。从拿到样品到获得结果,RT-LAMP所需时间小于1小时。进一步分析表明,RT-LAMP对无症状患者也是可行的,并且不会与其他呼吸道病原体感染发生交叉反应。
    文章认为此RT-LAMP检测方法为SARS-CoV-2感染提供了一种快速、灵敏、直观的检测方法,有助于公共领域的COVID-19检测和医院推广。
    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。
    4.附件:
    原文链接
    https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.05.20.20108530v1

  • 原文来源:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.05.20.20108530v1
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    • 5月23日,medRxiv发表了题为“Development and clinical application of a rapid and sensitive loop-mediated isothermal amplification test for SARS-CoV-2 infection”的文章。 SARS-CoV-2的爆发迫切需要灵敏、方便的COVID-19诊断方法以保证患者的及时治疗。本文中开发和验证了一种新的逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)方法,可在合格的实验室和护理点检测SARS-CoV-2。 研究方法为在2020年1月26日至4月8日期间,从两家医院招募了疑似COVID-19和密切接触患者。采集呼吸样本,用LAMP方法进行检测,并与RT-qPCR结果进行比较。对这两种方法之间不一致的样本进行下一代测序确认。此外,还检测了无症状COVID-19携带者和其他呼吸道病毒感染患者的RT-LAMP。 结果共收集了129例(329个鼻咽拭子)和76例(152个鼻咽拭子和痰样本)的独立样本。RT-LAMP方法的准确性(总敏感性和特异性分别为88.89%和99.00%;阳性和阴性预测值分别为94.74%和97.78%)和诊断有用性(阳性和阴性似然比为88.89和0.11)已被验证。与RT-qPCR的SARS-CoV-2筛查相比,RT-LAMP表现出更高的灵敏度(88.89%比81.48%)和一致性(kappa为0.92),并只需恒温加热和目测检查。从拿到样品到获得结果,RT-LAMP所需时间小于1小时。进一步分析表明,RT-LAMP对无症状患者也是可行的,并且不会与其他呼吸道病原体感染发生交叉反应。 文章认为此RT-LAMP检测方法为SARS-CoV-2感染提供了一种快速、灵敏、直观的检测方法,有助于公共领域的COVID-19检测和医院推广。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。
  • 《3月3日_反转录RT-LAMP法可快速检测SARS-CoV-2》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-03-05
    • 1.时间:2020年3月3日 2.机构或团队:山东第一医科大学附属济南中心医院;山东大学附属济南中心医院;济南市疾病预防控制中心;济南市传染病医院 3.事件概要: 2020年3月3日,medRxiv预印平台出版了山东第一医科大学附属济南中心医院等机构的题为“Rapid Detection of SARS-CoV-2 Using Reverse transcription RT-LAMP method”的文章。 新型冠状病毒病(COVID-19)是由SARS-CoV-2引起的一种可危及患者生命的疾病。实时荧光PCR(RT-PCR)是SARS-CoV-2核酸检测的临床标准方法。为了更早检测SARS-CoV-2并及时控制疾病的传播,研究人员建立了一种更加快速和简便的SARS-CoV-2核酸检测方法—RT-LAMP法(反转录环介导等温扩增)。RT-LAMP法中,RNA反转录和核酸扩增可在63℃恒温条件下一步完成,并能同时检测ORF1ab基因、E基因和N基因,30分钟内即可得到结果。ORF1ab基因有较强的特异性,N基因有较强的灵敏性,两者的同时检测可以保证SARS-CoV-2的灵敏性与特异性。RT-LAMP法与RT-PCR法在检测灵敏性上相近,且运用RT-LAMP法对208份临床样本的检测结果显示,其特异性高达99%。该研究所报道的RT-LAMP法具有快速扩增、操作简便、检测便捷等优点,可用于对SARS-CoV-2快速、可靠的临床诊断。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.02.20030130v2