《两种RT-qPCR方法在自动化工作流程中检测SARS-CoV-2的灵敏性和特异性》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-03-18
  • medRxiv预印版于3月10日发表了巴西Sabin 医疗诊断公司发表的论文“Analytical sensibility and specificity of two RT-qPCR protocols for SARS-CoV-2 detection performed in an automated workflow”。文章称制定可靠的SARS-CoV-2实验室诊断成为必须,以便及早识别、隔离和为患者提供最佳的护理。呼吸道分泌物的RT-qPCR检测通常用于检测急性呼吸道感染中的致病病毒。用于检测SARS-CoV-2的RT-qPCR实验方法已有报道,这些实验方法的验证被认为是COVID-19的关键知识缺口,特别是大量检测时。
    研究人员调查了在全自动平台上对SARS-CoV-2进行定性检测的两个暂行的RT-qPCR方案的分析灵敏性和特异性。研究人员发现在其条件下,N1和RdRP(修饰的)基因对RNA靶标显示出最高的分析灵敏度。原始浓度的E区域被认为是第三位确诊分析。综上所述,N1、RdRP(优化)和E基因在研究人员针对COVID-19病毒的自动RT-qPCR工作流程中表现出了适当的分析灵敏性和特异性,E基因的灵敏性比其他基因至少低4倍。这项研究强调了在向人群提供检测之前,对实验室检测进行局部验证的重要性。利用合成的RT-qPCR靶点研究自动化工作流程中新的检测诊断参数,是为即将到来的威胁做好准备的一种快速、简单、有效的方法。
    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

  • 原文来源:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.07.20032326v1
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    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-03-12
    • 1.时间:2020年3月10日 2.机构或团队:巴西Sabin医疗诊断公司 3. 事件概要: medRxiv预印版于3月10日发表了巴西Sabin 医疗诊断公司发表的论文“Analytical sensibility and specificity of two RT-qPCR protocols for SARS-CoV-2 detection performed in an automated workflow”。文章称制定可靠的SARS-CoV-2实验室诊断成为必须,以便及早识别、隔离和为患者提供最佳的护理。呼吸道分泌物的RT-qPCR检测通常用于检测急性呼吸道感染中的致病病毒。用于检测SARS-CoV-2的RT-qPCR实验方法已有报道,这些实验方法的验证被认为是COVID-19的关键知识缺口,特别是大量检测时。 研究人员调查了在全自动平台上对SARS-CoV-2进行定性检测的两个暂行的RT-qPCR方案的分析灵敏性和特异性。研究人员发现在其条件下,N1和RdRP(修饰的)基因对RNA靶标显示出最高的分析灵敏度。原始浓度的E区域被认为是第三位确诊分析。综上所述,N1、RdRP(优化)和E基因在研究人员针对COVID-19病毒的自动RT-qPCR工作流程中表现出了适当的分析灵敏性和特异性,E基因的灵敏性比其他基因至少低4倍。这项研究强调了在向人群提供检测之前,对实验室检测进行局部验证的重要性。利用合成的RT-qPCR靶点研究自动化工作流程中新的检测诊断参数,是为即将到来的威胁做好准备的一种快速、简单、有效的方法。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件 原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.07.20032326v1
  • 《COVID-19快速检测显示高度灵敏性》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-10-10
    • 由谢菲尔德大学的研究人员最近发表了他们对一种新的,快速COVID-19测试技术的评估结果。LamPORE是一种用于检测SARS-CoV-2RNA的新型诊断平台,将环介导的等温扩增与纳米孔测序相结合,有潜力在一台仪器上每天分析成千上万个样品。 尽管是初步的,但结果表明LamPORE的诊断敏感性很高,这可能意味着将来可提供更大的检测规模来帮助控制SARS-CoV-2大流行。 谢菲尔德大学与英国公共卫生部Porton Down(PHE),谢菲尔德教学医院NHS基金会信托基金和牛津大学的同事之间的合作,评估了LamPORE针对RT-PCR的性能。 研究小组使用了从两种样品中提取的RNA。阳性临床标本主要来自有症状感染的患者,其中LamPORE的诊断敏感性为99.1%(即RT-PCR阳性的228个样本中有226个阳性)。 在阴性临床标本中,包括153个检测到的其他呼吸道病原体中,LamPORE的诊断特异性为99.6%(即279个中的278个为阴性RT-PCR阴性)。总体而言,有1.4%的样品在首次测试时产生不确定的结果,并且对同一RNA提取物重复进行LamPORE测试的可重复性为96.8%。 这些结果表明,LamPORE具有与RT-PCR相似的诊断症状患者SARS-CoV-2感染的性能。 谢菲尔德大学感染,免疫和心血管疾病学系的Suchhan de Silva博士说:“这些初步但有希望的数据表明LamPORE有可能扩大SARS-CoV-2检测的类型和规模。” 来自Porton Down英格兰公共卫生的Steve Pullan博士说:“我们的早期数据表明LamPORE是基于PCR的常规诊断方法的可靠替代方法,它有可能提供进一步的高通量检测能力。”