由新出现的SARS-CoV-2引起的冠状病毒疾病COVID-19已对全球公共卫生,经济和社会稳定构成严重威胁,要求迅速开发治疗方法和预防措施。在这项研究中,我们首先验证了SARS-CoV-2使用人ACE2作为细胞受体,其S蛋白具有较高的膜融合活性。与SARS-CoV的序列相比,SARS-CoV-2的S2融合蛋白中的七肽重复序列1(HR1)序列能显着提高的α-螺旋性和热稳定性,以及与相应的七肽重复序列2位点的更高的结合亲和力。然后,我们设计了一种基于HR2序列的脂肽融合抑制剂,称为IPB02,在抑制SARS-CoV-2 S蛋白介导的细胞-细胞融合和假病毒感染中表现出很高的活性。 IPB02还有效抑制了SARS-CoV伪病毒。此外,IPB02的结构和活性关系(SAR)用一组截短的脂肽表征,揭示了对其结合和抗病毒能力至关重要的氨基酸基序。因此,本文的结果为理解SARS-CoV-2的进入途径和靶向膜融合步骤的抗病毒药物设计提供了重要信息。