《复旦学者NAR发文:开发出高性能“基因魔剪”》

  • 来源专题:转基因生物新品种培育
  • 编译者: 王晶静
  • 发布时间:2021-03-29
  • 王永明/王红艳/李继喜团队合作CRISPR/Cas9被誉为“基因魔剪”,是基因编辑的利器,在基础研究、农业育种和基因治疗等领域得到了广泛应用。CRISPR/Cas9工具还存在很多局限。常用的SpCas9编辑范围广,活性高,但是基因大,给病毒载体递送带来困难。常用的SaCas9基因小,但是编辑范围小。其他Cas9活性低,应用较少。为了找到理想的Cas9工具酶,复旦大学王永明课题组建立了大规模筛选Cas9的平台,对自然界中数百种Cas9进行系统性筛查。2020年该课题组筛选到了SauriCas9,具备活性高、编辑范围广、基因小等优点,但是精准性不理想,介于SpCas9和SaCas9之间。
    2021年3月12号,王永明课题组联合王红艳和李继喜课题组在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上发表了题为“Discovery and engineering of small SlugCas9 with broad targeting range and high specificity and activity”的研究论文。论文中,经过研究者鉴定和改造,开发出SlugCas9-HF工具酶,性能突出。它识别简单的NNGG PAM,具备活性高、精准性高、编辑范围广、基因小等优点。研究者同时还开发出ShaCas9、SlutrCas9、Sa-SlugCas9等工具。为了方便研究人员选择合适的工具酶使用,作者对本团队开发的7种工具酶和SaCas9的活性和精准性进行了比较。综合看,SlugCas9-HF在编辑活性、精准性和编辑范围都具有优势。该研究的第一作者胡子英博士兴奋地说:“我们后继工作对SlugCas9-HF和SpCas9的活性进行了比较,它们活性没有差异。也就是说SlugCas9-HF兼具了SpCas9和SaCas9的优点。这是我们一直寻找的理想工具酶,它在很多场景都可以取代SpCas9和SaCas9。我们还找到很多有优点的工具酶,将陆续与同行分享。”胡子英博士和张成东博士是论文的共同第一作者,王永明教授、王红艳教授和李继喜教授是论文的共同通讯作者。全文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33721016/

相关报告
  • 《中国学者本周CNS发文6篇,浙大“开挂”》

    • 来源专题:科技大数据监测服务平台
    • 编译者:dingxq
    • 发布时间:2019-12-17
    • 看点预告 ● 浙大继续“开挂”,拿下今年第9篇CNS ● 昆明理工研究成果登上Nature,同一团队10月刚完成Science首秀 ● 寻找马约拉纳零能模再下一城,中国科学院丁洪、高鸿钧团队发Science 本周,中国学者在Cell、Nature和Science上共发文6篇。 其中,浙大、昆明理工、港大分别完成3篇Nature,2篇Science由中国科学院物理所、香港中文大学团队完成,1篇Cell为中国科学院分子细胞中心、武大等单位联手完成。 Nature 浙大今年第9篇顶刊:找出人类自身炎症疾病“幕后元凶” 相关论文信息: https://www.nature.com/articles/s41586-019-1830-y 研究人员发现病人体内的RIPK1基因突变会导致细胞产生凋亡和程序性坏死,进而导致炎症因子水平异常升高,出现发热等症状。 找到致病机制后,研究者与医生提出了更精准的治疗方案,并取得良好疗效。 本文的4位共同通讯作者中,周青、俞晓敏来自浙江大学,王晓川来自复旦大学附属儿科医院。 周青,浙江大学生命科学研究院研究员、美国临床分子遗传学执业主任医师、美国医学遗传学与基因组学学院专家委员,主要研究方向包括自身炎症疾病和临床遗传诊断。 曾因发现ADA2 在单核细胞/巨噬细胞分化中起重要作用,影响血管完整性等成果两次登上《新英格兰医学》。 值得注意的是,本文是浙大今年第9篇顶刊论文,被网友称为“开挂的速度”。
  • 《美Battelle开发出确保基因合成生物安全的DNA筛选平台》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:huangcui
    • 发布时间:2019-01-18
    • 新兴生物技术具有双重用途的特点,需要在工业上采取生物安保措施,特别是在根据订单生产DNA序列的基因合成机构。由美国巴特尔纪念研究所(Battelle)人员开发的ThreatSEQ™ DNA筛查网络服务是第一个实物数据库,建立在对病原体危险因素的十多年研究基础之上。它汇集了超过10000个关注序列,包括来自75种细菌、96种病毒、12种真核病原体和其他致病因子的850个关注序列类型。该服务包括一个先进的生物配置渠道,减少了合成供应商维护有效生物安保的负担。该平台通过面向行业的用户界面简化审查流程来审查筛选结果,从而用高质量的元数据和基因组背景的图形表示。ThreatSEQ近期被R&D100创新奖评为最终入围者,该奖项旨在表彰年度最具创新性的100项技术。