《2023年9月,这些研究登上了Cell Press期刊封面》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2023-12-04
  • 2023年10月16日,Cell Press发布了九月份登上Cell Press期刊封面的研究论文,全文如下:

    Cell Metabolism

    出版时间:2023年09月05日 

    本期Cell Metabolism封面研究表明,非酒精性脂肪肝患者摄入抗性淀粉四个月后,肝内甘油三酯含量会有效降低,而肠道微生物群组成和功能的变化是重要介质。在“以食为药”理念的启发下,封面图片描绘了山脉(肝脏)在营养“雨水”(富含抗性淀粉的食物)的滋润下,以及土壤和土壤微生物群的支持下,重新焕发生机,象征着脂肪肝在肠道和肠道微生物群的支持下得到缓解。

    Matter

    出版时间:2023年09月06日

    本期Matter封面研究报道了一维纤铁矿(lepidocrocite)纳米丝(基于二氧化钛)的合成和光催化制氢。封面图片中的显微照片展现了底层二氧化钛纳米丝的丝状性质和一维性。研究人员将一维二氧化钛的水性胶体悬浮液注入有机溶剂中,制成了该样品。

    Cell Stem Cell

    出版时间:2023年09月07日

    本期Cell Stem Cell封面研究表明,利用4CL培养基和MYCN/BCL2过表达,可以通过猪胚胎生成具备优异种间嵌合潜力的人多能干细胞。研究人员在存在肾缺陷的猪体内成功生成人源化中肾(mesonephroi),为在猪体内培育人类肾脏铺平了道路。封面图片描绘的是一只会飞的猪,手中捧着一个神奇的葫芦(象征中国神话中的炼丹炉),葫芦里装有经MYCN/BCL2强化的 4CL 培养基,这种培养基赋予人多能干细胞超强的种间嵌合能力。猪身上的腰包表示空置的肾脏微环境,由人体细胞填充,象征在体内成功生成人源化中肾。

    Structure

    出版时间:2023年09月07日

    主蛋白酶(main protease, Mpro)是一种极具吸引力的泛冠状病毒治疗靶点,在冠状病毒的复制过程中发挥着至关重要的作用。由日本盐野义制药(Shionogi)开发的 Ensitrelvir (S-217622) 是首个具备口服活性、非共价、非肽类的新冠病毒Mpro抑制剂,对其他人类冠状病毒以及需要关注和需要留意的新冠病毒变异株,也有抗病毒疗效。封面图片展示了Mpro与Ensitrelvir复合物的晶体结构以及Ensitrelvir的抑制机制。本期Structure封面研究阐述了Ensitrelvir抑制Mpro的分子基础。

    Med

    出版时间:2023年09月08日

    铜绿假单胞菌(pseudomonas aeruginosa)被列入世界卫生组织“重点病原体”清单,是急需新治疗手段的传染病菌。噬菌体疗法可以克服目前抗菌治疗的一些局限性。本期Med封面研究报告了迄今为止在铜绿假单胞菌感染未愈患者中同情使用(compassionate use)单一噬菌体的最大规模系列病例。研究报告,85%的患者临床结局良好,不良反应有限,表明在传统治疗无效的情况下,该PASA16 噬菌体可能对铜绿假单胞菌感染患者有益。

    Patterns

    出版时间:2023年09月08日

    用于自动生成放射学解读报告的人工智能模型有望提高放射科医生的工作效率并减轻其工作负担。但这些模型的开发在很大程度上取决于是否有自动化指标(automated metrics),能对人工智能生成的报告进行临床相关评估。本期Patterns封面研究聚焦放射科医生对报告生成错误的评分与自动化指标的一致性。研究人员还提出了两个新指标,RadGraph F1和RadCliQ,这两个指标与放射科医生评价的相关性更好。封面图片以课堂的形式,展示了人类放射科医生和自动化指标在“教授”人工智能模型生成放射报告中的协同作用。人类教师(放射科医生)和机器教师(自动化指标)正在评估学生的论文样本(人工智能生成的放射学报告),以指导班上的学生(人工智能模型)撰写更符合黄金标准(目标报告)的论文。

    Cancer Cell

    出版时间:2023年09月11日

    本期Cancer Cell封面研究发现,不同类型的脑转移瘤会以一种非常特殊的方式影响神经元回路及其振荡模式,可以通过机器学习工具进行解码,以对脑转移瘤进行预测和分类。癌细胞的转录组特征表明,这些影响可能是由分子程序而非肿瘤质量效应决定的,又或者除了肿瘤质量效应之外,还存在分子程序的因素。封面图片描绘了转移癌细胞(红色肿块)在大脑中的定植。转移细胞通过特定的旁分泌交流影响神经元活动(不断掉落的箭号),这反过来又会导致微电路运行的改变和大脑振荡的扭曲(白色轨迹)。

    Immunity

    出版时间:2023年09月12日

    淋巴结是诱导适应性免疫反应的关键部位。本期Immunity封面研究聚焦胰腺、肝脏和十二指肠之间共有的淋巴结引流的影响,并揭示了一个层次结构,即源自不同淋巴结的树突细胞在共同部位混合后,会对炎症和耐受产生不同的影响。封面图片将不同器官的贡献描绘成一条公交线路(“肝脏线”,绿色;“胰腺线”,蓝色;“十二指肠线”,红色),这些线路经过淋巴结站点并连接成一个中心环路(图中放大部分)。胰腺线止于肝脏、腹腔和十二指肠淋巴结,肝脏线止于肝脏和腹腔淋巴结,十二指肠线止于腹腔和十二指肠淋巴结。这些引流模式促成了每个淋巴结中不同的迁移性树突细胞成分,从而影响T细胞结局,并最终影响组织自身免疫。封面图片灵感来自芝加哥市的地铁路线图。

    Cell Genomics

    出版时间:2023年09月13日

    封面图片是1991年在南蒂罗尔阿尔卑斯山发现的距今5350年的天然冰川木乃伊“?tzi”。本期Cell Genomics封面研究利用从这具木乃伊左侧髂骨中提取的DNA重建了高质量的基因组,从而深入了解这个独特的铜器时代个体的种群历史和表型。研究还发现,该木乃伊的皮肤颜色可能比现代欧洲大陆人深,而且有男性秃顶的倾向。这两种表型都与该木乃伊的真实外观一致。

    Cell Host & Microbe

    出版时间:2023年09月13日

    封面图片描绘了与人乳低聚糖(human milk oligosaccharides,HMO)合用时,长双歧杆菌婴儿亚种(Bifidobacterium longum subspecies infantis, B. infantis)在肠道微生物群中的接种情况。封面图片将B. infantis描绘成散布在肠道中的微生物“种子”,存在HMO“肥料”时,B. infantis在肠道的接种水平就会很高。本期Cell Host & Microbe封面研究开展了精准微生物组工程,将HMO联合B. infantis引入受抗生素干扰的成人肠道微生物组,产生的可复制变化包括与产丙酸韦荣氏球菌属(Veillonella spp.)互养,以及一系列肠道代谢物变化。

    Cell

    出版时间:2023年09月14日

    自噬选择性地清除细胞质内的物质,包括内质网和线粒体,这对细胞和生物体的健康非常重要。本期Cell封面研究揭示了线粒体和内质网之间的交流以及自噬在发育过程中对内质网的选择性清除。封面图片展示的是透射电子显微镜下的果蝇肠道细胞,其内有许多包含粗糙内质网或线粒体的双膜自噬体结构。

    Chem

    出版时间:2023年09月14日

    本期Chem封面研究通过亚胺键连接螺旋体和有机单元,构建了二维分子编织,从而形成了铁丝网状的图案。这种独特的编织图案不依赖长线交错,而是通过共价有机框架化学中使用的积木式方法所产生的。

    iScience

    出版时间:2023年09月15日

    穿越时空,回到始新世(Eocene)时期的那阳盆地(Na Duong Basin)。本期iScience封面研究结合艺术和科学,重建了非凡的古环境,揭示了一个繁荣的水生领域。研究人员通过细致的分析和令人惊叹的插图,带我们走进东南亚的化石宝库,将这个时期统治东南亚的鳄目和龟鳖目动物,栩栩如生地呈现在我们面前。

    One Earth

    出版时间:2023年09月15日

    今年《巴黎协定》完成了首次“全球盘点”(Global Stocktake)。全球盘点验证了众所周知的事实--迄今为止我们所取得的进展还不够,同时也为提高气候目标铺平了道路。本期One Earth封面图片来自Alisa Singer的“环境涂鸦:气候变化的艺术”系列,题为“扩大可再生能源规模是可行的”,强调了清洁能源转型的潜力。这幅作品展示了美国近年来天然气和太阳能/风能扩张的案例,展现了发展大规模可再生能源,从而实现美国 2035 年“电力零碳污染目标”的可行性。

    Cell Reports Medicine

    出版时间:2023年09月19日

    本期Cell Reports Medicine封面研究生成了胶质瘤免疫细胞的单细胞分辨率图谱并揭示,肿瘤相关单核细胞(tumor-associated monocyte, TAMo)是预后不良和间充质转化的标志物。TAMo 起源于血液中的单核细胞,胶质瘤会对其进行重编程,使其分泌表皮生长因子受体配体EREG和AREG,进而激活表皮生长因子受体信号转导,促进胶质瘤细胞的间充质转化。封面图片展现了TAMo 和胶质瘤之间的这种重要交流,突显了该研究成果的转化潜力。

    Cell Reports Physical Science

    出版时间:2023年09月20日

    本期Cell Reports Physical Science封面研究报告了一种高效的钢基钙钛矿太阳能电池,阐明了背侧铟锡氧化物(ITO)中间层作为屏障、阻止铁从钢基板扩散出来的重要作用,以及利用二维钙钛矿消除顶面钝化缺陷,从而提升电池性能和稳定性的方法。

    Cell Systems

    出版时间:2023年09月20日

    封面图片展示的是带有类器官的微孔阵列。本期Cell Systems封面研究介绍了一种微孔平台,可在单细胞/类器官分辨率水平对类器官进行表型分析。研究人员对生长速度、运动以及顶端-基底极性等各种表型特征进行了分析。结合类器官物理检索和单个类器官测序机制,微孔平台可对目标表型进行基因型-表型匹配。

    Joule

    出版时间:2023年09月20日

    封面图片描绘的是一个儿童眼中,在城市背景中飞行的电动垂直起降(eVTOL,electric vertical take-off and landing)飞机。这是从一架大型传统飞机上俯瞰的画面,反映了人类社会即将向电动航空过渡的趋势,这预示着可持续空中交通新时代的到来。封面图片用孩童对eVTOL飞机的着迷,来展现人们对这种飞机日益增长的热情,但其能否取得长期成功则取决于对关键科学和技术挑战的全面审视和理解。本期Joule封面研究开发了一个机械建模和虚拟分析平台,将eVTOL 架构和任务要求与基本的锂离子电池动力学联系起来,揭示了关键的性能限制因素和设计权衡,并强调了针对特定应用开发eVTOL电池的必要性。

    Neuron

    出版时间:2023年09月20日

    动物为满足生存需要,必须进行风险评估。本期Neuron封面研究探讨了觅食与在捕食者威胁下自我保护这两种状态并存时的中枢和行为机制。封面图片描绘了一只小鼠与一群捕食者玩扑克牌,这是一场成本效益游戏,背景墙上是食物的画像,这个场景让人不禁想起柯立芝(Cassius Marcellus Coolidge)的名画《滑铁卢(A Waterloo)》。

    Cell Chemical Biology

    出版时间:2023年09月21日

    封面图片中,在特制宝剑(MHC-II 诱导剂)的帮助下,中国传说中的怒目金刚(T 细胞)通过用手(TCR)识别红色的魔兽角(MHC-II)来检测恶魔(癌细胞)。本期Cell Chemical Biology封面研究发现了新型小分子 MHC-II 诱导剂(降植烷pristane 及其衍生物),可克服肿瘤中MHC-II缺乏的情况,促进 T 细胞对癌细胞的检测,并通过 FASN 抑制(蓝色魔兽的口器)点燃冰冷的肿瘤微环境(蓝海)。

    Chem Catalysis

    出版时间:2023年09月21日

    封面图片利用珠宝镶嵌工艺展现了双功能电催化剂的构建过程。本期Chem Catalysis封面研究将亚纳米级的铂簇协同整合到超小 RuO2纳米粒子的多孔纳米薄层中,并使其均匀地生长在高导电石墨烯上,从而得到了一种高活性、耐用的双功能氧催化剂(Pt/RuO2/G),适用于锂氧电池。

    Molecular Cell

    出版时间:2023年09月21日

    本期Molecular Cell封面图片旨在以艺术的方式呈现“绿色实验室”的概念,反映Molecular Cell对分子生物学和可持续发展之间关系的一定关注。有许多方法不仅可以降低一个活跃的研究实验室的负面影响,还可以让人们看到如何将基础研究应用于监测,甚至对环境产生积极影响,我们希望借此提高广大学术同仁对这些方法的认识。

    Cell Reports Methods

    出版时间:2023年09月25日

    本期Cell Reports Methods封面研究介绍了一种基于小分子有机探针(small-molecule organic probes, SMOPs)的成像方法:多色扩增受激发射损耗(multicolor expansion stimulated emission depletion, ExSTED),这种方法可实现细胞结构的纳米级分辨率成像。封面图片是用肌动蛋白 SMOP 染色的U2OS细胞在扩增后用共聚焦显微镜成像得到的彩色编码、xy方向最大强度投影。

    Current Biology

    出版时间:2023年09月25日

    彼氏鼠耳蝠(Bechstein’s bat,Myotis bechsteinii)见于欧洲大部分地区,非常适应森林栖息地。每年夏天,雌性蝙蝠都会回到它们的出生地,在那里形成孕产蝙蝠群,共同抚养后代。在此期间,温度对幼蝠的发育至关重要,幼蝠的成年体型与预期寿命呈负相关。本期Current Biology封面研究证明,在幼蝠的生长阶段,人为提高栖息地温度会导致幼蝠体型变大,这可能是由于相对温暖的条件下节约了新陈代谢。这些结果表明,躯体生长与猎物充足程度也许无关,或许存在直接机制,气候变化由此改变适应性相关特征。

    Developmental Cell

    出版时间:2023年09月25日

    封面图片展示的是极性蛋白 OPL4-BFP(青色)和 BRXL2-YFP(黄色)在拟南芥(Arabidopsis thaliana)子叶表皮细胞中相反的定位模式,其中呈品红色的是细胞轮廓。双极性形成于不对称细胞分裂前(中心图案),每种极性蛋白被固着在不同的子细胞中,以指导气孔系的不同细胞命运进展(附属图案)。两个极性域分别由蓝色和黄色轨迹标记。OPL蛋白家族如何调节气孔前体的干细胞行为?更多信息,请参阅本期Developmental Cell封面研究。

    Cell Reports

    出版时间:2023年09月26日

    封面图片展示的是小鼠大脑胼胝体神经元从感觉皮层(红色)向对侧半球的轴突投射,该小鼠伴有出生前中等剂量酒精暴露史,标记染色采用的是DAPI(蓝色)和抗神经丝-160(绿色)。本期Cell Reports封面研究发现,microRNA 介导的轴突导向调控改变,可能会影响胎儿酒精谱系障碍(fetal alcohol spectrum disorders)的大脑半球间皮层连通性和相关行为。

    Cell

    出版时间:2023年09月28日

    本期Cell的一组封面研究,以单细胞分辨率、跨细胞类型共同展示了阿尔茨海默症背后的基因组、表观基因组和转录组失调。封面图片描绘了一组具备周期性的西班牙瓷砖,象征着健康大脑中脑细胞和基因组的系统结构。随着病情的恶化,在神经元退化和小胶质细胞活化的影响下,基因组组织会受到侵蚀并出现混乱,这反映了阿尔茨海默症对大脑细胞和分子景观的破坏性影响。

    本文内容转载自“Cell Press”微信公众号。

    原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/H86_lhOJOUUZ7b4UHonrSA






相关报告
  • 《PLOS期刊更新人体研究政策》

    • 来源专题:科技期刊发展智库
    • 编译者:华宁
    • 发布时间:2023-04-26
    •   最近,PLOS和其他出版商发现:涉及操纵出版程序的大规模案件有所增加。PLOS的工作人员正在努力提高出版流程的严格性,以防止出版有问题的文章。作为这项工作的一部分,PLOS更新了部分期刊的人体研究伦理政策:自2023年3月1日起,这些期刊要求涉及人体参与研究的作者在提交论文的同时提供原始伦理批准文件。这也适用于使用人类受试者数据或原始组织样本的研究,但根据机构和(或)国家要求免于伦理批准的研究除外。   学术出版、终身职位和聘用决定的天然的竞争性可能会导致研究人员走捷径,在道德方面做出妥协,以提高出版速度。在某些情况下,这可能意味着在获得所有必要的批准之前进行研究。在其他情况下,这可能意味着购买作者身份或文章内容,或损害同行评审过程的完整性。这些不道德的做法会产生问题文章,进而对更广泛的学术社区造成伤害。   PLOS对其发表的研究一直有很高的道德标准。到目前为止,PLOS期刊一直要求涉及人类参与者的研究提交文件包括一份伦理声明,说明有关该研究的伦理批准和知情同意程序。有时,期刊的工作人员对政策的遵守情况有所担忧,因此会要求提供有关研究的伦理批准文件。   最近,PLOS出版伦理团队处理了很多案件,在这些案件的调查过程中,引发了人们对研究过程中是否坚持了伦理标准、是否有措施保护研究中的参与者,或报告的结果是否可靠的关注。   鉴于这些问题,PLOS ONE在2022年进行了一项试验,要求各组作者在同行评审前提供伦理批准文件。尽管遵守规定的程度很高,但期刊工作人员发现的情况令人深感不安:在一个组别中,近三分之二的提交材料不符合PLOS ONE的人体研究伦理政策。如果没有要求提供相关的伦理文件,将很难发现这些问题。因此,PLOS更新了PLOS ONE、PLOS Climate、PLOS Global Public Health和PLOS Water的人体研究伦理政策(2023年3月1日生效),同时也在考虑对PLOS其他期刊进行类似的政策更新。   根据新政策,在提交论文时将要求提供原始的伦理批准文件,并在同行评审前由期刊工作人员进行评估。如果对伦理批准文件有任何疑虑,如果未能提供这些文件,或者这些文件表明该研究不符合PLOS的相关政策,那么该稿件将被拒绝,无需外部审查。根据PLOS的长期政策,如果期刊工作人员或编辑委员会成员认为有必要,将要求2023年3月之前提交的稿件提供伦理批准文件。   仅凭这一更新的政策并不能识别所有潜在的欺诈性或不道德的研究。然而,这是PLOS为保障人类研究出版的完整性,维护伦理政策,并确保学术社区能够继续信任、重用和利用出版物而做出的重要努力。
  • 《转换期刊:2022年分析报告》

    • 来源专题:科技期刊发展智库
    • 编译者:华宁
    • 发布时间:2023-09-07
    • 6月21日,cOAlition S发布了转换期刊2022年的分析报告。cOAlition S支持若干转换策略。转换期刊(Transformative Journal, TJ)作为cOAlition S认可的策略之一,以鼓励订阅型出版商在规定的时间内过渡到完全和即时的开放获取(OA)。要获得TJ身份,期刊必须公开承诺过渡到完全开放获取并同意:努力按照公开商定的目标逐年增加开放获取内容的份额;从出版服务费中抵消订阅费(以避免重复收费)。 2022年数据的分析结果表明,在TJ计划中的2326 种期刊中: (1)自2023年1月1日起,26 种期刊(1%)转为完全开放获取(full OA); (2)695种期刊(30%)达到或超过了他们的OA增长目标并留在TJ计划中; (3)1589种期刊(68%)未能达到其OA增长目标,将从TJ计划中移除。 (4)其他16种期刊(1%)因其他原因从该计划中移除,包括出版商不再拥有该刊、已停止出版等。 所有的TJ出版商都收到一个报告模板,以说明他们在2022年发表了多少研究文章,以及有多少是以OA形式发表的。利用之前出版商提供的2021年数据,该模板确定2022年的增长目标是否已经实现,如果是,2023年新的OA渗透率目标是什么。该模板还收集了关于文章引用和下载的数据,以对比OA出版的文章与付费墙后发表的文章(在同一期刊中)的情况。 在分析报告中,所有期刊都被分配为以下4种互斥类型之一: (1)期刊已经从2023年1月1日转向完全OA(将不再被视为TJ); (2)期刊已达到OA的增长目标,并将在2023年继续作为TJ; (3)期刊未达到TJ的增长目标,并将从TJ计划中移除; (4)其他:包括已经停止出版的期刊,转移到其他出版商或出版商已经决定退出TJ计划。 如果出版商表示他们计划在2024年将部分期刊转向完全OA,这将被记录,但并不影响其TJ状态。例如,如果某种期刊错过了2022年的目标,即使该期刊计划在2024年转向完全OA,它仍将被归类为退出该计划的期刊。 在16家TJ出版商中,有7家(ASTMH、Company of Biologists、Karger、伦敦地质学会、洛克菲勒大学出版社、英国皇家学会和荷兰瓦赫宁根学术出版社)达到或超过了所有2022年的TJ目标。尽管这7家出版商出版的TJ数量相对较少(26种),但学会出版商似乎比一些商业对手更成功地实现了TJ目标。对于TJ数量较多的出版商而言,94%的BMJ期刊(32种)和62%的剑桥大学出版社期刊(240种)达到或超过了其增长目标。75%(3/4)的牛津大学出版社转换期刊已经转向完全OA;Springer Nature的11种期刊已经转向完全OA。这与剑桥大学出版社宣布的“大多数研究论文将在2025年前以开放获取形式出版”的目标一致,数据还显示,除了在2023年进行的5种期刊转换到OA之外,另外40种期刊将于2024年1月1日开始转换到OA。 比较2022年和2021年提供的完全OA渗透率,可以看出向完全OA的转变已经开始。例如,在2021年,有851种转换期刊报告其OA渗透率低于10%;在2022年,渗透率小于10%的转换期刊已经降至578种。 尽管出现了上述这些积极的发展,但TJ计划中超过三分之二(68%)的期刊未能达到其OA增长目标。由于未能达到目标的期刊将被从TJ计划中移除,因此,1589种期刊将在2023年底失去其TJ资格。 从单个出版商的表现来看,迄今为止TJ计划中最大的出版商Springer Nature出版的1721种转换期刊中,有77%(1329种)未能达到其TJ目标。对于Elsevier和美国化学学会(ACS),比例分别是63%(115种)和56%(36种)。所有参与TJ计划的出版商提供的数据如下图所示。 如此多的期刊未能达到其OA增长目标,表明对于部分出版商而言,在合理的时间范围内不可能完成向全面和即时开放的转换。由于cOAlition S正在寻求鼓励有限时间内的转变,因此决定在2024年底终止该计划也是有根据的。 出版商申请TJ计划时的条件之一是,当OA渗透率达到或超过所出版的研究内容的75%时,该期刊将转为OA。但数据显示,2022年有25%的TJ其OA渗透率为10%或更低。 尽管达到了75%的OA渗透率,但Springer Nature出版的至少6种期刊已经单方面退出TJ计划。例如,2022年发表在European Journal for Security Research上的所有文章都是OA的;International Review of Intellectual Property and Competition Law 的OA渗透率是95%。如果一种期刊在完全OA渗透率水平上仍然不愿意转为OA,唯一合理的结论即是它们永远不会转为OA。 平均而言,相比同一期刊中的订阅内容,OA内容下载量更高。例如,Springer Nature报告称,在2022年,同一转换期刊上发表的OA文章平均比订阅文章使用率高1.4倍。然而,引用数据却不那么明显。例如,在Elsevier 转换期刊上发表的OA文章,与在同样的期刊上发表的付费文章相比,平均引用次数相差不大:OA文章平均引用1.3次,而付费文章平均引用1.2次。 参与TJ计划的出版商还需要展示OA内容的出版对其订阅价格的影响。如果每年出版的内容体量保持不变,随着OA内容比例的增加,预期订阅价格会下降。例如,英国皇家学会展示了期刊Biology Letters的订阅价格因OA内容比例的增加而下降了4.74%(即使加上4.1%的通货膨胀)。 在2021年的TJ报告中,cOAlition S呼吁所有TJ出版商效仿英国皇家学会的做法,在期刊层面展示OA内容的可用性对订阅价格的影响。但许多出版商(包括ACS、Elsevier和Springer Nature)继续提供更多的通用声明,订阅者无法确认他们实际上是否支付了OA内容的费用。