2023年10月4日,美国剑桥大学及阿斯利康的研究人员等在Nature上发表了题为Rare variant associations with plasma protein levels in the UK Biobank的文章。先前的蛋白质基因组学研究主要集中在通过全基因组关联研究的常见变异上,罕见变异对血浆蛋白质组的贡献在很大程度上仍然未知。该研究确定了在49,736名英国生物银行个体中测量的罕见蛋白质编码变异体和2,923种血浆蛋白丰度之间的关联。
该研究的变异水平外显子组全关联研究发现了5433种罕见的基因型-蛋白关联,其中81%在之前对同一队列的全基因组关联研究中未被发现。然后,研究人员使用基因水平的崩溃分析来观察聚合信号,揭示了1962个基因-蛋白质关联。在691个来自蛋白截断变异的基因水平信号中,99.4%与蛋白水平下降有关。编码参与血浆蛋白清除的清道夫受体的STAB1和STAB2以多效位点出现,分别与77和41个蛋白相关。研究人员通过几个应用程序演示了公共可访问资源的效用。其中包括详细描述NLRC4的等位基因系列,确定HSD17B13中脂肪肝相关变异的潜在生物标志物,以及通过将蛋白质数量性状位点与蛋白质截断变异整合到坍塌分析中来支持全现象关联研究。最后,该研究揭示了克隆造血(CH)的不同蛋白质组学后果,包括TET2-CH和FLT3水平升高之间的关联。该研究结果强调了血浆蛋白丰度的罕见变异和蛋白质基因组学在治疗发现中的价值。
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