《Nature | 血浆蛋白质组中的器官衰老特征跟踪健康和疾病》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2023-12-11
  • 2023年12月6日,斯坦福大学等机构的研究人员在Nature上发表了题为Organ aging signatures in the plasma proteome track health and disease的文章。

    动物研究表明,个体之间以及个体内部器官之间的衰老情况各不相同,但这是否适用于人类以及它对与年龄有关的疾病的影响尚不清楚。

    该研究利用来自特定器官的人类血浆蛋白水平来测量活体个体的器官特异性衰老差异。利用机器学习模型,研究人员分析了11个主要器官的衰老,并在5个独立的队列中可重复地估计了器官年龄,这些队列包括5676名成年人。研究人员发现近20%的人在一个器官上表现出强烈的衰老加速,1.7%的人是多器官衰老。器官加速老化会增加20-50%的死亡风险,而器官特异性疾病与这些器官的加速老化有关。研究人员发现心脏加速老化的个体心力衰竭风险增加250%,大脑和血管加速老化独立于血浆pTau-181预测阿尔茨海默病(AD)的进展,并且与血浆pTau-181一样强,pTau-181是目前最好的AD血液生物标志物。

    该研究的模型将血管钙化、细胞外基质改变和突触蛋白脱落与早期认知能力下降联系起来,介绍了一种简单且可解释的方法,利用血浆蛋白质组学数据研究器官衰老,预测疾病和衰老效应。


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    • 2023年10月4日,美国剑桥大学的研究人员等在Nature上发表了题为Plasma proteomic associations with genetics and health in the UK Biobank的文章。制药蛋白质组学项目是一个竞争前的生物制药联盟,对54,219名英国生物银行参与者的血浆蛋白质组学特征进行了分析。该研究提供了该计划的详细总结,包括技术和生物学验证,对蛋白质组疾病特征的见解,以及各种人口和健康指标的预测模型。 该研究展示了2,923种蛋白质的综合蛋白质数量性状位点(pQTL)定位,确定了14,287种主要遗传关联,其中81%以前未被描述,以及非欧洲个体的祖先特异性pQTL定位。该研究提供了血浆蛋白质组遗传结构的最新特征,并结合了随着样本量和蛋白质组学分析覆盖率随时间增加而预测的pQTL发现率。研究人员对跨多个生物域的反式pqtl提供了广泛的见解,强调了在多种细胞因子和补体网络中对配体-受体相互作用和途径扰动的遗传影响,并说明了ABO血型和FUT2分泌状态对胃肠道组织富集表达的蛋白质的远程上位性影响。该研究通过将蛋白质靶点(如PCSK9)的遗传代理效应扩展到其他端点,并解开与COVID-19易感性相关的位点上受干扰的特定基因和蛋白质,证明了这些数据在药物发现中的实用性。这种公私合作伙伴关系为科学界提供了一个相当广泛和深入的开放获取的蛋白质组学资源,以帮助阐明蛋白质基因组学发现的生物学机制,并加速生物标志物、预测模型和治疗方法的发展。 本文内容转载自“ CNS推送BioMed”微信公众号。 原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/lHh011wh7XclQqUOKHFsAw
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    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2023-10-08
    • 2023年10月4日,安进子公司deCODE Genetics在Nature上发表了题为Large-scale plasma proteomics comparisons through genetics and disease associations的文章。高通量蛋白质组学平台测量血浆中数千种蛋白质,结合基因组和表型信息,有能力弥合基因组和疾病之间的差距。该研究对英国生物银行制药蛋白质组学项目生成的Olink Explore 3072数据进行了关联研究,这些数据来自5万多名英国生物银行参与者的血浆样本,具有表型和基因型数据,按英国或爱尔兰、非洲和南亚血统分层。 研究人员将结果与SomaScan v4对36000名冰岛人血浆的研究结果进行了比较,其中1514人的Olink数据也可用。研究人员发现两个平台之间存在适度的相关性。虽然在两个平台上检测到的顺式蛋白数量性状位点的绝对数量相似(在Olink上为2101个,而在SomaScan上为2120个),但在Olink平台上具有此类分析性能支持证据的分析比例更高(72%对43%)。相当多的蛋白质具有不同平台之间的基因组关联。该研究提供了一些例子,说明平台之间的差异可能会影响从蛋白质水平与疾病研究的整合中得出的结论。研究人员展示了如何利用英国生物银行参与者的不同血统来帮助检测新的关联和完善基因组定位。该研究结果显示了两种最常用的高通量蛋白质组学平台提供的信息的价值,并展示了它们之间的差异,这些差异有时提供了有用的互补性。 本文内容转载自“ CNS推送BioMed”微信公众号。 原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/lHh011wh7XclQqUOKHFsAw