为了了解辣椒果实颜色形成的机理，对4种不同水果颜色的辣椒品种进行了代谢组学和转录组的综合分析。共鉴定到188种黄酮类化合物，其中紫色品种的花青素、黄酮醇和黄酮类化合物含量明显高于其他品种，这与黄酮类化合物合成和调控基因的高表达有关。利用加权基因共表达网络分析，确定类黄酮合成相关模块和调控类黄酮合成和转运的候选基因。此外，对12种类胡萝卜素的分析表明，4个辣椒品种在开花期50天的叶黄素含量存在显著差异，这是由于类胡萝卜素通路下游基因表达差异造成的。我们的研究结果为了解辣椒果实中类黄酮和类胡萝卜素的合成和积累提供了新的见解。
