尽管线粒体治疗法的发展主要集中在由线粒体DNA突变或编译线粒体蛋白突变引起的疾病，但同时，人们也发现线粒体功能障碍会导致多种常见疾病，包括神经变性、代谢疾病、 心力衰竭、缺血再灌注损伤和原虫感染。 因此，线粒体成为这些高度流行疾病的重要药物靶标。多种旨在治疗恢复线粒体功能的医疗策略已被开发，更有少数药物已进入临床试验。 本综述讨论了针对常见病理学进一步开发线粒体药理学所面临的机遇和挑战。
