《结合表型和靶向药物发现的力量》

  • 来源专题:重大新药创制—研发动态
  • 编译者: 杜慧
  • 发布时间:2018-11-26
  • 表型筛查和靶向筛查哪个方法在药物研发中更有利存在着巨大的争议。调和这两种方法的机会在于表型筛查后成功的目标反卷积(TD)。但是,尽管有大量可用的体外TD方法,但是将表型活性化合物与生物分子靶标匹配的任务仍然存在着问题。因此,本文详细介绍了加速TD的计算机技术的最新发展。最终,目标反卷积使我们能够从表型和靶向筛查方法中获益。

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  • 《数据驱动的药物重新定位框架发现了靶向COVID-19的潜在治疗剂》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-03-19
    • 江苏省疾病预防控制中心等于2020年3月12日在bioRxiv上发表题为“A data-driven drug repositioning framework discovered a potential therapeutic agent targeting COVID-19”的文章。 文章指出,研究人员开发了一个数据驱动的药物重新定位框架,该框架应用机器学习和统计分析方法来系统地集成和挖掘大规模知识图谱、文献和转录组数据,以发现针对SARS-CoV-2的潜在候选药物;使用过去的SARS-CoV和MERS-CoV数据进行的回顾性研究表明,该基于机器学习的方法可以成功预测针对特定冠状病毒的有效候选药物;计算机筛选随后通过实验室验证表明,目前正在进行I期临床试验的聚ADP-核糖聚合酶1(PARP1)抑制剂CVL218可用于治疗COVID-19;体外测定表明,CVL218表现出对SARS-CoV-2复制的有效抑制活性,而没有明显的细胞病变;CVL218能够抑制CpG诱导的外周血单个核细胞中IL-6的产生,表明它也可能具有抗炎作用;在大鼠和猴子中进一步的药代动力学和毒物代谢动力学评估表明,肺中CVL218的浓度很高,并且没有明显的毒性迹象,表明该药物具有治疗SARS-CoV-2感染引起的肺炎的潜力;此外,分子模拟表明,CVL218可能与SARS-CoV-2的核衣壳(N)蛋白的N末端结构域结合,这为解释其抗病毒作用提供了可能的模型。作者指出,PARP1抑制剂CVL218可以作为治疗COVID-19的潜在药物。
  • 《用于药物发现和开发的串联虚拟筛选和斑马鱼模型》

    • 来源专题:新药创制
    • 编译者:杜慧
    • 发布时间:2022-11-19
    • 虚拟筛选(VS)技术与斑马鱼模型体内筛选相结合,目前正在以更快、更有效的方式用于药物开发。 我们回顾了不同的虚拟筛选技术,斑马鱼作为脊椎动物模型用于药物发现的用途以及它们之间存在的协同作用。 我们强调了将虚拟和斑马鱼幼虫筛选相结合用于药物发现的优势。一方面,在处理大型化合物库时,VS是比体内筛选更快、更便宜的工具,可用于搜索活性化合物和可能的治疗候选物。另一方面,斑马鱼幼体形成脊椎动物模型,允许体内筛选大量的化合物。转基因和突变斑马鱼品系的可用性允许分析治疗后的特定表型以及毒性、脱靶效应、副作用和剂量。还对VS的优势、体内全动物方法筛选以及筛选组合进行了综述。