《数据驱动的药物重新定位框架发现了靶向COVID-19的潜在治疗剂》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-03-19
  • 江苏省疾病预防控制中心等于2020年3月12日在bioRxiv上发表题为“A data-driven drug repositioning framework discovered a potential therapeutic agent targeting COVID-19”的文章。
    文章指出,研究人员开发了一个数据驱动的药物重新定位框架,该框架应用机器学习和统计分析方法来系统地集成和挖掘大规模知识图谱、文献和转录组数据,以发现针对SARS-CoV-2的潜在候选药物;使用过去的SARS-CoV和MERS-CoV数据进行的回顾性研究表明,该基于机器学习的方法可以成功预测针对特定冠状病毒的有效候选药物;计算机筛选随后通过实验室验证表明,目前正在进行I期临床试验的聚ADP-核糖聚合酶1(PARP1)抑制剂CVL218可用于治疗COVID-19;体外测定表明,CVL218表现出对SARS-CoV-2复制的有效抑制活性,而没有明显的细胞病变;CVL218能够抑制CpG诱导的外周血单个核细胞中IL-6的产生,表明它也可能具有抗炎作用;在大鼠和猴子中进一步的药代动力学和毒物代谢动力学评估表明,肺中CVL218的浓度很高,并且没有明显的毒性迹象,表明该药物具有治疗SARS-CoV-2感染引起的肺炎的潜力;此外,分子模拟表明,CVL218可能与SARS-CoV-2的核衣壳(N)蛋白的N末端结构域结合,这为解释其抗病毒作用提供了可能的模型。作者指出,PARP1抑制剂CVL218可以作为治疗COVID-19的潜在药物。

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.11.986836v1
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    • 1.时间:2020年3月12日 2.机构或团队:江苏省疾病预防控制中心、清华大学交叉信息研究院、中国科学院上海药物研究所等 3.事件概要: 江苏省疾病预防控制中心等于2020年3月12日在bioRxiv上发表题为“A data-driven drug repositioning framework discovered a potential therapeutic agent targeting COVID-19”的文章。 文章指出,研究人员开发了一个数据驱动的药物重新定位框架,该框架应用机器学习和统计分析方法来系统地集成和挖掘大规模知识图谱、文献和转录组数据,以发现针对SARS-CoV-2的潜在候选药物;使用过去的SARS-CoV和MERS-CoV数据进行的回顾性研究表明,该基于机器学习的方法可以成功预测针对特定冠状病毒的有效候选药物;计算机筛选随后通过实验室验证表明,目前正在进行I期临床试验的聚ADP-核糖聚合酶1(PARP1)抑制剂CVL218可用于治疗COVID-19;体外测定表明,CVL218表现出对SARS-CoV-2复制的有效抑制活性,而没有明显的细胞病变;CVL218能够抑制CpG诱导的外周血单个核细胞中IL-6的产生,表明它也可能具有抗炎作用;在大鼠和猴子中进一步的药代动力学和毒物代谢动力学评估表明,肺中CVL218的浓度很高,并且没有明显的毒性迹象,表明该药物具有治疗SARS-CoV-2感染引起的肺炎的潜力;此外,分子模拟表明,CVL218可能与SARS-CoV-2的核衣壳(N)蛋白的N末端结构域结合,这为解释其抗病毒作用提供了可能的模型。作者指出,PARP1抑制剂CVL218可以作为治疗COVID-19的潜在药物。 4.附件: 原文链接 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.11.986836v1
  • 《艾曲波帕是治疗COVID-19的潜在药物》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-06-27
    • 中国医学科学院北京协和医学院等于6月12日在Infection, Genetics and Evolution上发表题为“Eltrombopag is a potential target for drug intervention in SARS-CoV-2 spike protein”的文章。文章指出,当前由SARS-CoV-2引起的COVID-19大流行是全球的威胁,迫切需要寻找有效的治疗方法。SARS-CoV-2的跨膜刺突(S)糖蛋白直接与宿主血管紧张素转换酶2(ACE2)结合,介导病毒进入细胞,因此被认为是一个有前景的药物靶点。考虑到新药开发是一个耗时的过程,药物重新定位可能有利于快速发现应对突发性传染病的药物。文章中,研究人员比较了SARS-CoV-2和SARS-CoV虚拟结构蛋白的差异,选择了主要定位在S2域融合核心的口袋进行药物筛选。研究人员采用虚拟药物设计算法筛选了食品药品管理局批准的1234种化合物的药物库,通过人工筛选得到了13种得分最高的化合物。通过体外分子相互作用实验,进一步验证了艾曲波帕(eltrombopag)与S蛋白和人ACE2具有较高的结合亲和力,并有可能影响ACE2-S蛋白复合物的稳定性。因此,艾曲波帕作为治疗SARS-CoV-2感染的潜在药物值得进一步探讨。