《抗SARS-CoV-2 RNA依赖性RNA聚合酶的潜在化学结构》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2020-04-02
  • 武汉爆发了2019年病毒病(COVID-19),并已迅速蔓延到世界各地。对于冠状病毒,RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)是一种重要的蛋白酶,可催化RNA从RNA模板的复制,并且是有吸引力的治疗靶标。在这项研究中,我们通过分子对接研究针对SARS-CoV-2,SARS-CoV和MERS的RdRp进行了分子对接研究,从被证明对SARS-CoV具有抗病毒活性的中药中筛选了这些化学结构。我们发现茶黄素在SARS-CoV-2(-9.11 kcal / mol),SARS-CoV(-8.03 kcal / mol)和MERS-CoV(-8.26 kcal / mol)的RdRp的催化口袋中具有较低的idock分数。来自idock。为了证实该结果,我们发现,通过使用Blind Docking服务器,茶黄素停靠在SARS-CoV-2 RdRp的催化口袋中时,其结合能较低,为-8.8 kcal / mol。关于接触方式,疏水相互作用显着地促进了结合,并且在茶黄素和RdRp之间发现了另外的氢键。此外,茶黄素与来自Blind Docking服务器的Arg553之间形成了一种π阳离子相互作用。我们的结果表明,茶黄素可能是潜在的SARS-CoV-2 RdRp抑制剂,需要进一步研究。

  • 原文来源:;https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jmv.25761
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