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《SARS-CoV-2 RNA依赖性RNA聚合酶中的Fe-S辅助因子是潜在的抗病毒靶点》

  • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
  • 编译者： 蒋君
  • 发布时间：2021-06-10

  • SARS-CoV-2是新冠肺炎的病原体，它使用依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRp)进行基因组复制和基因转录。2021年6月3日，美国国立卫生研究院的研究人员发现RdRp的催化亚基nsp12在低温电子显微镜的RdRp复合物结构中连接两个铁硫金属辅助因子，被建模为锌中心的位点[]。这些金属结合位点对于病毒解旋酶的复制和相互作用至关重要。在细胞培养中，稳定的氮氧化物TEMPOL对簇的氧化作用导致它们的分解，有效抑制RdRp，并阻断SARS-CoV-2的复制。因此，这些铁硫簇可作为SARS-CoV-2 RdRp的辅助因子，是COVID-19治疗的靶点。

  • 原文来源：;https://science.sciencemag.org/content/early/2021/06/02/science.abi5224.long
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    • 编译者：蒋君
    • 发布时间：2020-04-02
    • 武汉爆发了2019年病毒病（COVID-19），并已迅速蔓延到世界各地。对于冠状病毒，RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）是一种重要的蛋白酶，可催化RNA从RNA模板的复制，并且是有吸引力的治疗靶标。在这项研究中，我们通过分子对接研究针对SARS-CoV-2，SARS-CoV和MERS的RdRp进行了分子对接研究，从被证明对SARS-CoV具有抗病毒活性的中药中筛选了这些化学结构。我们发现茶黄素在SARS-CoV-2（-9.11 kcal / mol），SARS-CoV（-8.03 kcal / mol）和MERS-CoV（-8.26 kcal / mol）的RdRp的催化口袋中具有较低的idock分数。来自idock。为了证实该结果，我们发现，通过使用Blind Docking服务器，茶黄素停靠在SARS-CoV-2 RdRp的催化口袋中时，其结合能较低，为-8.8 kcal / mol。关于接触方式，疏水相互作用显着地促进了结合，并且在茶黄素和RdRp之间发现了另外的氢键。此外，茶黄素与来自Blind Docking服务器的Arg553之间形成了一种π阳离子相互作用。我们的结果表明，茶黄素可能是潜在的SARS-CoV-2 RdRp抑制剂，需要进一步研究。
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  • 《COVID-19病毒RNA依赖的RNA聚合酶的结构》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
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    • 清华大学联合多家机构在Science发表论文“Structure of the RNA-dependent RNA polymerase from COVID-19 virus”。 文章重点研究了在病毒复制和转录周期中起关键作用的复合物，他们使用低温电子显微镜来确定RNA依赖的RNA聚合酶nsp12的2.9埃分辨率的结构，该酶与两个辅助因子nsp7和nsp8结合，催化病毒RNA的合成。nsp12是核苷类抗病毒抑制剂如瑞德西韦的靶点，其结构可能为设计新的抗病毒药物提供基础。
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