《SARS-CoV-2 RNA依赖性RNA聚合酶中的Fe-S辅助因子是潜在的抗病毒靶点》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2021-06-10
  • SARS-CoV-2是新冠肺炎的病原体,它使用依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRp)进行基因组复制和基因转录。2021年6月3日,美国国立卫生研究院的研究人员发现RdRp的催化亚基nsp12在低温电子显微镜的RdRp复合物结构中连接两个铁硫金属辅助因子,被建模为锌中心的位点[]。这些金属结合位点对于病毒解旋酶的复制和相互作用至关重要。在细胞培养中,稳定的氮氧化物TEMPOL对簇的氧化作用导致它们的分解,有效抑制RdRp,并阻断SARS-CoV-2的复制。因此,这些铁硫簇可作为SARS-CoV-2 RdRp的辅助因子,是COVID-19治疗的靶点。

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    • 编译者:蒋君
    • 发布时间:2020-04-02
    • 武汉爆发了2019年病毒病(COVID-19),并已迅速蔓延到世界各地。对于冠状病毒,RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)是一种重要的蛋白酶,可催化RNA从RNA模板的复制,并且是有吸引力的治疗靶标。在这项研究中,我们通过分子对接研究针对SARS-CoV-2,SARS-CoV和MERS的RdRp进行了分子对接研究,从被证明对SARS-CoV具有抗病毒活性的中药中筛选了这些化学结构。我们发现茶黄素在SARS-CoV-2(-9.11 kcal / mol),SARS-CoV(-8.03 kcal / mol)和MERS-CoV(-8.26 kcal / mol)的RdRp的催化口袋中具有较低的idock分数。来自idock。为了证实该结果,我们发现,通过使用Blind Docking服务器,茶黄素停靠在SARS-CoV-2 RdRp的催化口袋中时,其结合能较低,为-8.8 kcal / mol。关于接触方式,疏水相互作用显着地促进了结合,并且在茶黄素和RdRp之间发现了另外的氢键。此外,茶黄素与来自Blind Docking服务器的Arg553之间形成了一种π阳离子相互作用。我们的结果表明,茶黄素可能是潜在的SARS-CoV-2 RdRp抑制剂,需要进一步研究。
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    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-05-21
    • 清华大学联合多家机构在Science发表论文“Structure of the RNA-dependent RNA polymerase from COVID-19 virus”。 文章重点研究了在病毒复制和转录周期中起关键作用的复合物,他们使用低温电子显微镜来确定RNA依赖的RNA聚合酶nsp12的2.9埃分辨率的结构,该酶与两个辅助因子nsp7和nsp8结合,催化病毒RNA的合成。nsp12是核苷类抗病毒抑制剂如瑞德西韦的靶点,其结构可能为设计新的抗病毒药物提供基础。