《柬埔寨首例输入型COVID-19病例的宏基因组分析》

• 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
• 编译者： hujm
• 发布时间：2020-03-12
• 原文来源：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.02.968818v1

    美国国家过敏和传染病研究所疟疾与媒介研究实验室科研人员在bioRxiv预印本平台发表论文“Rapid metagenomic characterization of a case of imported COVID-19 in Cambodia ”，基于iSeq100 Illumina平台的新一代宏基因组测序技术，结合开源生物信息学管道，快速确定柬埔寨第一例COVID-2019的特征。
    测序结果与NCBI中开源的数据进行比对后发现，该病例与NCBI中MN908947.1患者序列进行对比时，发现只有ORF3a处的第25654位核苷酸有差异，缬氨酸变成亮氨酸，其他高度相似。