《SARS-CoV-2基于扩增子的MinION测序及COVID-19患者鼻咽拭子的宏基因组分析》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-03-17
  • 英国、中国、沙特等国的研究人员在medRxiv预印版平台发表论文“Amplicon based MinION sequencing of SARS-CoV-2 and metagenomic characterisation of nasopharyngeal swabs from patients with COVID-19”。文章指出COVID-19是一种复杂的疾病表型,其中潜在的微生物群可能会影响发病率和死亡率。研究人员基于扩增子和宏基因组学的MinION测序用于快速(在8小时内)鉴定SARS-CoV-2并评估了国际严重急性呼吸道和新兴感染协会(ISARIC) 4C联盟从COVID-19患者获得的鼻咽拭子中的微生物群。
    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

  • 原文来源:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.05.20032011v1
相关报告
  • 《3月8日_SARS-CoV-2基于扩增子的MinION测序及COVID-19患者鼻咽拭子的宏基因组分析》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:xuwenwhlib
    • 发布时间:2020-03-10
    • 3月8日_SARS-CoV-2基于扩增子的MinION测序及COVID-19患者鼻咽拭子的宏基因组分析 1.时间:2020年3月8日 2.机构或团队:英国利物浦大学、英国公共卫生部、西北农林科技大学、英国利物浦大学医院NHS基金会信托基金、英国爱丁堡大学、英国牛津大学纳菲尔德医学院、英国布里斯托尔大学、伊拉克库尔德斯坦地区Sulaimany兽医局、沙特法赫德国王医疗城研究中心、澳大利亚彼得多尔蒂感染与免疫研究所、新加坡科技研究局新加坡免疫学信息网、英国帝国理工学院、英国爱丁堡大学罗斯林研究所 3.事件概要: 英国、中国、沙特等国的研究人员在medRxiv预印版平台发表论文“Amplicon based MinION sequencing of SARS-CoV-2 and metagenomic characterisation of nasopharyngeal swabs from patients with COVID-19”。文章指出COVID-19是一种复杂的疾病表型,其中潜在的微生物群可能会影响发病率和死亡率。研究人员基于扩增子和宏基因组学的MinION测序用于快速(在8小时内)鉴定SARS-CoV-2并评估了国际严重急性呼吸道和新兴感染协会(ISARIC) 4C联盟从COVID-19患者获得的鼻咽拭子中的微生物群。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.05.20032011v1
  • 《COVID-19患者咽拭子标本SARS-CoV-2检测假阴性结果的分析和预测:一项回顾性研究》

    • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
    • 编译者:蒋君
    • 发布时间:2020-05-13
    • SARS-CoV-2核酸检测的假阴性结果对COVID-19患者和医务工作者构成了威胁。该研究旨在建立多变量模型来确定有助于SARS-CoV-2核酸检测假阴性结果的临床特征,并使用它们预测假阴性结果以及检测阳性结果的时间窗。该项回顾性队列研究纳入2020年1月15日至2020年2月19日在同济医院(大学医院)1,324名门诊COVID-19患者,收集有关CT成像报告,血液常规检查和临床症状的临床信息。结果表明,COVID-19患者的检测结果和SARS-CoV-2检测的阳性窗口与CT成像结果,血液常规检查和临床症状有关。将CT成像报告,血液常规检查和临床症状中的相关信息纳入考虑范畴,有助于减少假阴性检查结果。我们认为,预测性AFT模型是预测SARS-CoV-2检测时间窗的首批统计模型之一,可以帮助临床医生提高诊断的准确性和效率,从而优化核酸检测的时机。