寨卡病毒感染与严重神经系统并发症和胎儿异常有关。然而对病毒感染、复制和脱落的发展变化知之甚少。在美洲猕猴和食蟹猴极易受目前流行的寨卡病毒感染是与血统密切相关的。皮下接种病毒后，在感染后1 天内检测到病毒RNA。在唾液、尿、脑脊液（脑脊液）和精液检测到病毒RNA，偶尔在阴道分泌物也可以检测到病毒RNA。尽管血浆和尿液病毒RNA在原发感染10天内清除，直到研究结束时还可以在唾液和精液检测到病毒RNA，病毒血症消除后3周后血液中也可检测到。血液中主要的寨卡病毒感染控制与快速的先天免疫和适应性免疫反应相关。研究人员还确定了病毒RNA的组织，包括脑、男性和女性的生殖器官，在感染的早期和晚期阶段。经过与异源菌株的原发性感染导致完全保护6个动物45天再次感染，这表明原寨卡病毒感染能引起保护性免疫反应。寨卡病毒早期侵入健康动物的神经系统以及唾液和精液脱落的程度和持续时间，可以关系对人类的神经系统并发症和非关节炎介导的传播。
