《巴西南部圣卡塔琳娜州结核杆菌分子流行病学初探》

  • 来源专题:结核病防治
  • 编译者: 李阳
  • 发布时间:2016-01-12
  • 开展结核杆菌分子流行病学研究有助于了解疾病的传播动力学、建立与结核病控制和预防相关的战略性措施。为此,来自圣卡塔琳娜州联邦大学的研究人员合作分析了源自巴西南部圣卡塔琳娜州的结核杆菌复合群(MTBC)临床分离株的临床、流行病学及分子特征,其相关成果于2016年1月6日发表在Tuberculosis上。

    研究人员通过一年时间从公共卫生中心实验室搜集到406例MTBC临床分离株,并采用间隔区寡聚核甘酸分型技术(spoligotyping)对其进行了分型。此外,还从巴西国家强制性疾病报告系统中搜集到人口学及临床资料。

    研究发现,圣卡塔琳娜州的病例主要发生于人口密度最高地区,其中约50%与结核病存在一定的关联关系;在采集的所有分离株中,5.7%为耐多药菌株,与药物滥用有关;大部分的分离株为LAM基因型比例为47.5%,T超家族分离株占25.9%,Haarlem家族占12.3%。此外,多间隔序列分型(MST)结果显示菌株主要分为两个组:第一组主要由LAM基因型菌株组成,第二组主要由T家族及Haarlem家族菌株组成,而其它谱系菌株则分布于周边地区。

    作者最后指出:这是首项对圣卡塔琳娜州结核杆菌人群结构进行探究的研究;间隔区寡聚核甘酸分型技术及其它的基因分型分析有助于结核控制和预防相关性战略措施的制定。

相关报告
  • 《巴西受艾滋病影响最严重地区的HIV-1分子流行病学史》

    • 来源专题:艾滋病防治
    • 编译者:门佩璇
    • 发布时间:2016-08-30
    • 在巴西地区,艾滋病高发病率和以HIV-1 C亚型为主要的病毒株是巴西最南端两个市(南里奥格兰德(RS)和圣卡塔琳娜州(SC))区别于巴西其他地区的两个显著特征。既往的HIV分子流行病学研究主要集中在省会城市,而对巴西地区特有的流行病学特征成因进行全面研究的报道较少。 本研究收集了巴西南部地区13个市的HIV感染者血液标本,提取其env和pol基因进行系统发育性分析,并在贝叶斯法中运用Skygrid和Logistic联合模型分析其病毒性人口系统动力学特征。 研究结果发现,在全样本分布中,HIV-1 C亚型发病率极高。在RS地区观察到较高的重组型病毒株频率。在SC市,B亚型和C亚型与不同的暴露人群相关。尽管Logistic模型结果得到HIV-1 C亚型和B亚型的增长率相似,但Skygrid图显示前者的流行规模更大,时间更久。本研究突出显示了在巴西南部地区HIV-1 C亚型流行规模一致。研究也探讨了异性恋和男男性行为者(MSM)传播链是如何对该地区HIV-1亚型的发病率产生影响的。 研究重要性:巴西南部地区艾滋病流行规模日益扩大,但是导致这种状况出现的环境因素尚不清楚。HIV-1 C亚型在该地区的省会城市呈现高流行,与巴西其他地区B亚型为主导的状况正好相反。本研究对巴西艾滋病高发病地区的某些城市的样本人群开展分析,比较性地探讨HIV-1 B亚型和C亚型的流行病学特征。研究结果显示,两种亚型在巴西地区呈现出不同的流行规模增长曲线。同时单独的传播链可能影响病毒系统动力学以及病毒新重组形式的出现。
  • 《国内一家结核病转诊医院中耐药结核杆菌的分子流行病学及临床特点研究》

    • 来源专题:结核病防治
    • 编译者:李阳
    • 发布时间:2014-10-16
    • 尽管国内存在大量的耐药结核病患者,但相较于针对结核杆菌分离株临床特点开展的分析而言,目前很少有研究全面分析了与耐药性相关的基因突变和基因型。基于此,来自中国科学院微生物研究所、香港大学、中国疾控中心结核病预防控制中心及309医院的研究人员从北京一家结核病转诊中心搜集115个结核杆菌临床分离株,对其表型和基因型耐药谱进行了分析,其相关成果于2014年10月10日发表在PLoS One上。 该研究采用28位点散在分布重复单位-数目可变串联重复序列分析(MIRU-VNTR)方法进行基因分型,并对从患者病历记录中检索到的社会人口学和临床相关数据进行分析。 研究从115个结核杆菌临床分离株中共鉴定出78种突变,包括42种先前研究报道的突变和36种新鉴定出的突变,发现一线抗结核药物表型和基因型耐药率之间存在显著的相关性(p<0.001)。基因分型结果显示115个结核杆菌临床分离株共有101种MIRU-VNTR基因型,其中20株(17.4%)组成一个集群,剩余的95株具有独特的基因型。此外,研究发现与集群菌株相关的再治疗患者数量和与独特MIRU-VNTR基因型相关的患者数量之比为75% VS 41.1%。 此外,研究还在被属于同一集群的结核杆菌菌株感染的患者中鉴定出临床流行病学联系,说明这些患者间存在潜在的病菌传播现象。 综上所述,该研究为结核杆菌潜在的耐药相关性突变方面的研究提供了一些有价值的信息,且研究中涉及的基因分型数据提示在诊断过程中强制执行基因分型将有助于对结核病传播进行更好地监测和控制。