在巴西地区，艾滋病高发病率和以HIV-1 C亚型为主要的病毒株是巴西最南端两个市（南里奥格兰德（RS）和圣卡塔琳娜州（SC））区别于巴西其他地区的两个显著特征。既往的HIV分子流行病学研究主要集中在省会城市，而对巴西地区特有的流行病学特征成因进行全面研究的报道较少。
本研究收集了巴西南部地区13个市的HIV感染者血液标本，提取其env和pol基因进行系统发育性分析，并在贝叶斯法中运用Skygrid和Logistic联合模型分析其病毒性人口系统动力学特征。
研究结果发现，在全样本分布中，HIV-1 C亚型发病率极高。在RS地区观察到较高的重组型病毒株频率。在SC市，B亚型和C亚型与不同的暴露人群相关。尽管Logistic模型结果得到HIV-1 C亚型和B亚型的增长率相似，但Skygrid图显示前者的流行规模更大，时间更久。本研究突出显示了在巴西南部地区HIV-1 C亚型流行规模一致。研究也探讨了异性恋和男男性行为者（MSM）传播链是如何对该地区HIV-1亚型的发病率产生影响的。
研究重要性：巴西南部地区艾滋病流行规模日益扩大，但是导致这种状况出现的环境因素尚不清楚。HIV-1 C亚型在该地区的省会城市呈现高流行，与巴西其他地区B亚型为主导的状况正好相反。本研究对巴西艾滋病高发病地区的某些城市的样本人群开展分析，比较性地探讨HIV-1 B亚型和C亚型的流行病学特征。研究结果显示，两种亚型在巴西地区呈现出不同的流行规模增长曲线。同时单独的传播链可能影响病毒系统动力学以及病毒新重组形式的出现。
