《孙佳姝课题组在微流控热泳生物传感方面取得系列进展》

  • 来源专题:中国科学院文献情报制造与材料知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: 万勇
  • 发布时间:2021-11-23
  • 近日,国家纳米科学中心孙佳姝课题组与中国人民解放军总医院第五医学中心江泽飞教授、张少华教授,复旦大学附属肿瘤医院戴波教授等合作,在基于功能核酸的微流控热泳生物传感领域取得系列进展。相关研究成果近期分别发表于《自然·通讯》(Nature Communications, 2021, 12, 2536)及《纳米·今日》(Nano Today, 2021, 38, 101203)。

    转移性乳腺癌(MBC)是一种包括多种不同亚型的异质性疾病,是全球女性癌症死亡的主要原因之一。外周血中肿瘤来源的细胞外囊泡(EVs)作为液体活检的重要靶标,在MBC的精准诊断和疗效评估方面具有重要的应用前景。研究人员采用一种快速、灵敏、低成本微流控热泳适体传感器,对血浆EV的乳腺癌相关蛋白质特征进行分析,有效排除血浆游离蛋白干扰(Nature Communications, 2021, 12, 2536)。设计了一种机器学习算法,基于8种EV乳腺癌蛋白表达水平构建EV蛋白特征,用于区分MBC患者、非转移性乳腺癌患者、年龄配对的健康对照者,准确率高达91.1 %。在训练队列、验证队列、前瞻队列研究中,EV蛋白特征可以监测MBC的治疗反应,对治疗后疾病进展(PD)与稳定/部分缓解(SD/PR)的区分准确率为88.5 %。EV蛋白特征还与接受治疗的MBC患者的无进展生存期(PFS)相关,其中前列腺癌生物标志物EV PSMA可以作为MBC患者PFS的独立预后因素。论文的第一作者为国家纳米科学中心特别研究助理田飞博士与中国人民解放军总医院第五医学中心张少华教授;通讯作者为国家纳米科学中心孙佳姝研究员、刘超研究员与中国人民解放军总医院第五医学中心江泽飞教授。

    EV携带肿瘤细胞的mRNA,在转录水平调控肿瘤增殖与转移,是一种重要的癌症诊断标志物。为克服qRT-PCR检测操作复杂、需要裂解大量EV等挑战,研究人员发展了结合DNA四面体探针与热泳汇聚的检测新方法(DTTA),实现了血清中EV mRNA的原位、高灵敏检测,检出限低至14 aM(Nano Today, 2021, 38, 101203)。DNA四面体探针具有较高的结构刚性,可通过被动输运高效进入外泌体,并依靠双悬臂特异识别EV中靶标PSA mRNA,产生荧光共振能量转移(FRET)信号。进一步通过热泳富集放大EV中的FRET信号,实现EV PSA mRNA的原位高灵敏检测,无需EV裂解、RNA提取、反转录等过程。使用DTTA测量前列腺穿刺病人的血清EV PSA mRNA含量,可以有效区分前列腺癌患者(PCa)与前列腺良性增生患者(BPH),AUC为0.93,显著优于血清生物标志物PSA(AUC 0.74),为前列腺癌精准检测提供了新思路。本论文的第一作者为国家纳米科学中心博士研究生韩子威、邓瑾琦与复旦大学附属肿瘤医院万方宁博士;通讯作者为国家纳米科学中心孙佳姝研究员、刘超研究员与复旦大学附属肿瘤医院戴波教授。

    上述系列研究工作获得国家自然科学基金委相关人才计划和重大研究计划,中国科学院战略性先导科技专项(B类),中国科学院基础前沿科学研究计划和科研仪器设备研制项目等资助。

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  • 《微生物所刘文军课题组在有限复制流感疫苗研制方面取得进展》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2018-05-09
    • 甲型流感病毒感染严重威胁全球公共健康并造成重大经济损失,而疫苗仍是防控流感最有效的手段。干扰素敏感(IFN -sensitive)和复制缺陷(replication-incompetent)流感疫苗因其在正常细胞中无法进行有效复制,却能够诱导机体产生强烈的免疫反应而备受关注,这类疫苗被认为将很有可能替代传统的灭活疫苗和减毒疫苗。非结构蛋白1(NS1)是甲型流感病毒的致病因子之一,在病毒的生命周期中发挥着多种重要作用,尤其是能够通过抑制RIG-I介导的I型IFN的产生来拮抗宿主的天然免疫反应。IFN敏感疫苗正是利用这一理论依据,将流感病毒的IFN拮抗功能去除,从而抑制病毒在体内的有效复制。目前主要使用IFN-α/β缺陷的Vero细胞或IFN功能低下的低日龄SPF鸡胚来繁殖此类疫苗病毒,但仍然无法满足此类疫苗病毒的生产需求。 刘文军课题组长期从事流感病毒的复制调控机制研究,前期围绕流感病毒NS1拮抗宿主抗病毒天然免疫反应的机制开展了系列研究工作(Journal of Virology,2016,90:6263– 6275;Cellular Microbiology,2017,19(2),e12643)。而该研究则利用NS1拮抗宿主抗病毒天然免疫的功能,制备了有限复制流感疫苗并建立了生产该类疫苗的细胞系。 该研究利用反向遗传技术在RIG-I敲除的293T细胞中成功包装出NS1蛋白38位和41位氨基酸双突变(NS1 R38A/K41A)的重组流感病毒,其包装效率要远远高于其在野生型293T细胞中的效率。并且,该重组病毒几乎丧失了IFN拮抗功能,在MDCK、A549甚至IFN-α/β缺陷的Vero细胞中传3-6代后即被细胞清除。为了能够大量生产此类有限复制的IFN敏感流感病毒,该团队利用Tet-On 3G系统建立了稳定表达野生型NS1蛋白的Vero细胞系,NS1 R38A/K41A病毒在该细胞系上能够稳定传20代以上并保持较高的病毒滴度。动物实验表明,NS1 R38A/K41A病毒能够感染小鼠并诱导强烈的天然免疫和获得性免疫,并抵抗A/WSN/33 (WSN)、A/Puerto Rico/8/1934 (PR8)和 A/California/04/2009 (CA04)流感病毒的再次攻击,但NS1 R38A/K41A病毒的致病力几乎丧失,并很快被排出体外。 综上所述,RIG-I敲除的293T细胞有助于NS1 R38A/K41A流感病毒的包装,稳定表达NS1的Vero细胞有助于NS1 R38A/K41A流感病毒的有效复制,该系统可以用于包装并生产有限复制的IFN敏感疫苗病毒。NS1 R38A/K41A流感病毒在正常细胞和小鼠体内的复制是有限的,是一种潜在的安全有效的干扰素敏感疫苗。 上述研究于2018年5月1日在线发表在 Frontiers in Cellular and Infection Microbiology上,刘文军研究员和孙蕾副研究员为文章通讯作者,博士生陈璨为第一作者。该研究得到国家重点研发计划、国家自然科学基金及中国科学院B类先导科技专项等项目的资助。
  • 《苏州医工所缪鹏课题组在电化学/荧光双模传感技术方面取得进展》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-07-20
    •  电化学传感器是利用待测物所引发的电信号变化与浓度或其他物理量之间存在的相关性关系进而定性或定量分析的一种方法。荧光传感器则是通过将待测物与识别基团特异性结合的信息传递给荧光基团,引发荧光强度或发射波长的改变实现定性或定量检测的方法。这两种技术所涉及的信号源及构建方法往往差异较大。在同一体系中采用两种技术进行同步检测不仅能够有效提高检测准确性,还能够降低所获取信号受到背景信号、仪器波动等因素的影响,在基础研究、环境检测、临床检验等领域具有广泛的应用前景。   近期,苏州医工所缪鹏研究员课题组发展了基于“手拉手”式DNA纳米结构组装的设计,并基于亚甲基蓝/红色荧光碳量子点开发了一种新型的针对循环肿瘤DNA的电化学/荧光双模传感器。首先将发卡探针A固定于电极表面;与目标核酸反应后,游离的单链区域可用于打开发卡探针B;同理,发卡探针C可通过类似的反应结合为Y型结构并置换出目标核酸序列用于循环反应;相邻结构间的单链可以进一步结合形成大型组装体。反应的可行性可通过理论计算与凝胶电泳成像证实(图1);同时,所合成的碳量子点抗干扰性强,在生理环境下能够保持高度的荧光稳定性(图2)。通过分析相应发夹探针末端标记的电化学与荧光信号源,能够有效地完成双模探测。通过一系列的条件优化与定量测试,建立了荧光强度、电化学强度与目标核酸浓度的线性校准曲线,能够实现6个数量级的较宽线性范围,同时也可通过荧光成像方便快捷地区分目标核酸的含量(图3)。本工作中发展的双模传感器设计新颖,具有较高的灵敏度,可扩展性强,能够为核酸分析及临床诊断提供有力的工具。   本工作得到了苏州市基础研究试点项目(SJC2021016)的资助,结果已发表Chemical Engineering Journal, 2022, 450, 138069 (IF=16.744)   论文链接: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1385894722035550