内源性逆转录病毒(ERV)代表古老病毒的宿主基因组“化石”。 泡沫病毒,包括那些形成内源性拷贝的病毒,为脊椎动物系统发育中的病毒 - 宿主共同分歧提供了强有力的证据。 先前在哺乳动物,两栖动物和鱼类中发现了内源性泡沫病毒(EFV)。 在这里,我们报告了一种新型的内源性泡沫病毒,称为ERV-Spuma-Spu,位于新西兰特有的濒危爬行动物 - 大蜥蜴(Sphenodon punctatus)的基因组中。 系统发育分析表明,泡沫病毒可能在数百万年内与宿主共同分化。 ERV-Spuma-Spu的发现填补了泡沫病毒化石记录的主要空白,并为逆转录病毒的早期进化提供了重要见解。