麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所的癌症项目已经建立了一个新的学术 - 工业伙伴关系计划,癌症依赖地图(DepMap)联盟。这项新的努力将支持发现癌症中有希望的治疗目标的努力以及用于识别最有可能从正在进行的治疗发现工作中受益的患者群体的生物标记物。
该联盟是该研究所DepMap项目的产物,该项目旨在系统地编目和识别数百种癌细胞系中遗传易感性和药物敏感性的生物标记物。
来自生物技术和制药行业的十位合作伙伴已加入DepMap Consortium,包括:
艾伯维
阿斯利康
拜尔
Bristol-Myers Squibb
印花布生命科学
Genentech,罗氏集团的成员
葛兰素史克公司
H3生物医学
Janssen Biotech,Inc。
Repare Therapeutics
“我们准备将所有癌症目标和所有患者群体用于开发治疗。这个目标比任何一个机构都要大 - 我们必须在整个研究生态系统中作为科学合作伙伴共同实现它,”副主任Jesse Boehm说。广泛癌症项目和DepMap项目的科学主任。 “这就是DepMap联盟正在努力实现的目标,我们对它的推出感到非常兴奋。”
癌细胞通过调节一种或多种基因的活性来适应潜在的致命突变和其他分子故障,在此过程中依赖于这些基因的存活和生长。由此产生的依赖性可能为新的精确指导药物或其他癌症治疗策略提供目标。在某些情况下,它们甚至可能被已经开发的药物利用。
通过建立联盟,该研究所为行业合作伙伴创建了一个机制,利用DepMap项目的广泛专业知识,数据,生物和计算工具来识别癌症依赖性,并帮助将有希望的新疗法用于临床。 Consortium合作伙伴和DepMap科学家将携手合作,共同发挥作用:
由Broad Institute的癌症细胞系工厂和癌症细胞系百科全书策划(并在许多情况下产生)的基因组特征的,源自患者的细胞系模型,
使用PRISM方法在分子条形码细胞系中进行大规模平行复合筛选,
通过Broad's Genetic Perturbation Platform通过Project Achilles进行的基因组CRISPR失去功能的“依赖性”筛选基因组特征细胞系,
计算方法和生物学家友好的工具和门户网站,用于探索数据,发现非凡的依赖关系,并找到具有分子特征的患者群体,从而产生这种依赖性。
DepMap项目每季度在发布之前公开发布新的依赖数据集合。
“DepMap联盟代表了一种理想的合作伙伴关系,”威廉哈恩说,他是广泛癌症项目的研究所成员,哈佛医学院医学教授,达纳法伯癌症研究所首席研究战略官,以及该教授的联合主任。 DepMap项目。 “我们的合作伙伴将深入了解技术和目标,同时为整个科学界提供数据使用。”
——文章发布于2019年7月17日