Xpert®MTB/RIF能快速检测出对利福平（RR）的耐药性，但该检测漏掉了导致rpoB突变的I491F-RR，这种突变在南部非洲很常见。此外，Xpert®MTB/RIF不能区分活结核分枝杆菌和死结核分枝杆菌。
研究人员探讨薄层琼脂（TLA）直接药敏试验（DST）检测埃斯瓦蒂尼地区结核分枝杆菌（MTB）及其耐药性能力。连续样本与Xpert®MTB/RIF和TLA并行检测利福平（1.0μg/ml）和氧氟沙星（2.0μg/ml）。在安特卫普的参考实验室，将TLA结果与Löwenstein-Jensen或7H11固体培养基上的间接DST以及其他表型和基因型检测进行比较，以解决不一致性。
TLA对MTB检测阳性率为7.1%，而对Xpert®MTB/RIF的阳性率为10.0%。在研究的4547个样本中，有200个菌株可用于与复合参考品进行比较。在中位数18.4天之内，TLA检测RR的敏感性为93.0%（CI-77.4-98.0），特异性为99.4%（CI 96.7-99.9），而Xpert®MTB/RIF的敏感性为62.5%（CI 42.7-78.8），特异性为99.3%（CI 96.2-99.9）。其中8株（占所有RR确诊分离株的28.6％）携带I491F突变，均由TLA检测到。TLA还正确鉴定了184株氧氟沙星S分离株中的183株（99.5%特异性，CI 97.0-99.9）。
综上所述，在野外条件下，TLA可快速检测RR，在这种特殊情况下，有助于检测Xpert®MTB/RIF以外的其他RR患者，这主要但不唯一地归因于I491F。TLA还可准确排除氟喹诺酮类药物的耐药性。
