《分子流行病学和抗生素在中国食品供应链的耐药表型与基因型的沙门氏菌》

  • 来源专题:食物与营养
  • 编译者: niexiuping
  • 发布时间:2017-03-26
  • 沙门氏菌是重要的人畜共患病原体,也是抗生素耐药基因的载体。在这里,对94个来自人类和食品生产的动物进行血清分型,多位点序列分型,评估表型(15抗生素(32)和基因型耐药基因)抗菌素耐药性零二血清型和35个序列类型(STS)进行鉴定。类似的基因克隆分离出动物和人类的共同祖先和暗示表明,动物作为一个主要的沙门氏菌源。在畜牧生产中抗生素的滥用似乎是超级耐药菌株的耐药和起源,后者是密切相关的β-内酰胺酶基因blaCTX-M,blaoxa-1-like,和blatem-1-like。由鸡、st17(南印第安娜)是一个新兴的超级耐药克隆的相关耐药基因扩展到其他ST克隆和血清型被传送到动物和人类

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    • 来源专题:动植物疫病
    • 编译者:刘小燕
    • 发布时间:2020-10-31
    • 非伤寒沙门氏菌(NTS)是世界范围内腹泻病最常见的病原之一,在越南因腹泻住院的儿童中已成为最常见的细菌病原体。为了更好地了解越南NTS肠胃炎的流行病学、血清分布、抗菌药物耐药性(AMR)和临床表现,我们对胡志明市三家三级医院之一收治的腹泻儿童分离的NTS进行了临床基因组学研究。2014年5月至2016年4月,招募了3166名因痢疾住院的儿童,发现有478名(~15%)儿童通过粪便培养感染了NTS。450个生成的基因组的分子血清分型确定了血清群的不同集合(B、C1、C2-C3、D1、E1、G、I、K、N、O、Q);然而,鼠伤寒沙门氏菌是最主要的血清型,占NTS分离株 的41.8% (188/450)。我们观察到世卫组织(WHO)推荐的一线治疗对AMR的患病率很高,NTS分离株中有一半以上(53.8%,242/450)对多种药物具有耐药性(MDR;对≥3种抗菌药具有耐药性)。 AMR基因检测与表型AMR检测呈正相关,对经验性抗菌药物的耐药性与住院时间显著延长有关(0.91天,p=0.04)。我们的工作表明,基因组测序是表征NTS中血清多样性和AMR谱的强大流行病学工具。我们建议对经验不足的抗生素治疗痢疾性腹泻进行重新评估,并支持使用全基因组测序技术对国际NTS进行持续监测。
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    • 来源专题:食物与营养
    • 编译者:lixiaoman
    • 发布时间:2016-07-08
    • 近年来,涉及新鲜农产品的食源性疾病有所增加。由受污染的食物的感染的风险恶化的抗生素耐药菌株的患病率增加。这项研究评估了在沙门氏菌中抗生素耐药率(N = 263)从农业生产到最终的包装产品。这项研究证实了新鲜的良好的生产环境的重要性,作为抗生素耐药沙门氏菌的潜在的水库和新鲜农产品,具有显着的临床意义。进一步的研究,以评估这些病原体的健康风险的实际水平,应包括在分离株的抗生素耐药决定基因的特性。