一项新的研究证明了一种新方法的有效性,即利用海水样本中的DNA来确定在给定的深海区域存在哪些鱼类。eDNAtec公司、加拿大渔业和海洋局以及纪念大学研究人员在11月4日出版的Plos One期刊上发表了这项研究成果。
监测深海鱼类多样性的能力对于执行可持续管理措施和了解商业捕鱼和气候变化的影响是必要的。然而,现有的诸如诱饵相机捕捉、拖网捕捞和声学监测等方法检测能力有限,很难应用到大部分海洋研究中。
一种称为eDNA代谢编码的新方法通过分析环境DNA(eDNA)来揭示特定栖息地中存在哪些鱼类,eDNA是生物体在进行正常活动时释放到周围环境中的DNA。
为了评估eDNA代谢码检测深海鱼类的有效性,McClenaghan及其同事将其应用于从拉布拉多海采集的2500米深处的海水样本。在深海水样(水深1400米或以上)中,eDNA-metabarcoding鉴定出11科11属8种。研究人员将他们的eDNA代谢编码结果与传统方法得到的结果进行了比较,发现他们提供了更广泛的鱼类多样性和其他分类信息,同时大大减少了后勤工作。这些优点使得eDNA的大规模应用成为一个重要的技术进步。
研究小组还利用不同体积的深海海水样本和不同的DNA引物(用于eDNA实验室分析的短链DNA)来探索eDNA的代谢编码,以确定存在哪些物种。他们的研究结果表明,深海环境需要对在较浅水域使用的方法进行一些调整,例如使用更大体积的水和使用多重引物来最大限度地检测物种。
作者补充道:“基因组学和计算工具的进步正在迅速扩大我们研究和监测生物多样性的能力,这是面对迅速而巨大的环境变化所急需的任务。我们的研究证明了eDNA分析方法在深海鱼类物种监测这一具有挑战性的工作中的实用性,并为其他人员采用这种方法奠定了基础。”
(张灿影 编译)