《Nature | FOXO1促CART干性、代谢适应和效应》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2024-04-14
  • 2024年4月10日,Peter MacCallum癌症中心Phillip K. Darcy通讯在Nature发表题为FOXO1 enhances CAR T cell stemness, metabolic fitness and efficacy的文章,发现转录因子FOXO1在靶向实体瘤时能显著增强嵌合抗原受体(CAR)T细胞的性能。

    在实体瘤微环境的背景下,由于慢性抗原暴露、免疫抑制和不充分的共刺激,CAR T细胞往往会屈服于终末分化和代谢功能障碍。研究者已经观察到,在使用抗CD19 CAR T细胞的癌症治疗中,更好的患者结果与更“干细胞样”的表型和线粒体质量增加相关。研究人员从这些观察中获得灵感,旨在确定能够提高CAR T细胞寿命和对抗实体癌效力的转录因子。与用IL-2和IL-7生长的细胞相比,IL-15先前已被证明可促进CAR T细胞中增强的持久性和代谢健康。在研究这种有益作用的分子基础时,该团队发现IL-15处理的CAR T细胞表型出FOXO1的富集表达谱,而FOXO1是一种已知在细胞代谢和干性维持中发挥关键作用的转录因子。

    通过全面的表观遗传学和转录组学分析,他们发现FOXO1和其他记忆相关基因在用IL-15培养的CAR T细胞中上调。有趣的是,FOXO1成为了一个关键参与者,它协调了一系列转录和表观遗传学变化,在不影响抗原相遇时效应功能的情况下维持了细胞状态。为了测试FOXO1的功能意义,研究人员在小鼠HER2特异性CAR T细胞中过表达了FOXO1(FOXO1-ADA)的组成型活性形式,在人Lewis Y靶向的CAR T细胞中过表达野生型FOXO1。结果令人震惊:FOXO1过表达的CAR T细胞在代谢适应度方面表现出显著改善,其特征是线粒体功能增强和维持干细胞样表型的优越能力。

    此外,FOXO1在保持CAR T细胞的干性和促进体内持久性方面优于其他转录调节因子,如TCF7(TCF1)和ID3。这一新的见解表明,FOXO1驱动了一个多方面的转录和表观遗传学程序,赋予CAR T细胞抵抗耗竭并在实体瘤中保持长期抗肿瘤活性的能力。对FOXO1修饰的CAR T细胞转录组的分析揭示了一个独特的特征,该特征富含与T细胞记忆和持久性相关的基因。同时,表观遗传学改变支持了这种耐久性的增强,表明FOXO1作为一种主调节因子,重新连接CAR T细胞内的代谢机制,以抵消肿瘤微环境的有害影响。

    总之,该研究表明,FOXO1过表达是增强CAR T细胞对抗实体瘤疗效的有效策略。通过基因工程增强有利的代谢表型,研究人员为潜在的变革性临床应用奠定了基础,FOXO1工程CAR T细胞表现出增强的干性、代谢适应性和整体体内性能。这一发现为实体瘤免疫疗法的未来发展提供了希望。

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    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2023-11-13
    • 本文内容转载自“ immunity速读”微信公众号。原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/WfoQPRGVNHOTo4psVC4k_g 2023年11月8日,斯坦福大学Ansuman T. Satpathy和Caleb A. Lareau团队在Nature发表题为Latent human herpesvirus 6 is reactivated in CAR T cells的文章。该研究对人类病毒再激活,特别是人类疱疹病毒6型(human herpesvirus 6, HHV-6)在CAR T细胞疗法中的再激活,提供了重要见解。 通过分析大规模基因组学数据,作者发现T细胞样本中广泛存在HHV-6的转录,提示病毒在细胞培养过程中再激活。通过重新分析公共数据集,作者发现在体外培养的HIV感染或未感染的CD4+ T细胞中高达3.5%的序列化RNA其实是HHV-6B转录本,而HHV-6 DNA丰度也在整个培养过程中增加。利用CAR T细胞培养的单细胞RNA测序,作者发现少数HHV-6“超表达(super-expressor)”细胞正在再激活病毒。尽管这些超表达细胞仅占总数的0.2-0.3%,但它们贡献了99%以上的HHV-6转录本。超表达细胞被鉴定为CD4+ T细胞,与HHV-6B受体OX40在CD4+亚群中的表达一致。在延长培养后,HHV-6在整个细胞群中传播,导致高达62%的细胞表达病毒转录本。在培养过程中添加抗病毒药物foscarnet可降低病毒载量。 对接受FDA批准疗法的CAR T细胞患者的分析显示,输注后数周可在体内检测到HHV-6转录本,然而输注前未检测到。在72个样本中,输注后有28个样本被检出HHV-6+ CAR T细胞,包括13个类似超表达细胞的样本。在一位出现神经毒性症状的患者中,HHV-6+细胞含量在第7天高达血液T细胞总量的1/1000,之后在第14天变为不可检测,与神经毒性症状缓解的时间相关。在另一位患者中,经foscarnet治疗后HHV-6 DNA降至不可检测水平。对这位患者CAR T细胞的体外延长培养的第五天出现了HHV-6转录。与自体产品相比,需要更长时间的异体CAR T细胞也表现出了HHV-6再激活。在接受抗CD7异体CAR T细胞治疗的一位患者体内,捐赠者衍生的CAR T细胞和宿主细胞均促进了病毒转录。这项全面的基因组学研究证明,HHV-6可在T细胞培养过程中再激活,并传播到CAR T细胞产品和患者体内。单一时间点的筛查可能不足以识别最终产品中的HHV-6+细胞。病毒再激活的可能性应考虑于细胞疗法应用中,并视情况采取监测和减轻策略。